Как я могу изменить координаты из моего файла Bam с настраиваемого алигента генов на весь геном?
Я выполнил привязку моих чтений к ссылке, которая содержит только интересующие меня области гена (секвенирование на основе захвата), потому что я хотел сократить время анализа. Из-за этого мои файлы BAM и VCF относятся к этим регионам, а не ко всему геному.
Я хочу, чтобы мой файл был преобразован и связал их со всем геномом, но я не знаю, как это сделать.
Как я могу это сделать ?
Если вам нужна дополнительная информация, дайте мне знать.