набор данных 'ebicat37' не найден

Question

Я новичок в R и Bioconductor. В настоящее время прохожу онлайн-курс edX по биокондуктору. В соответствии с инструкциями, после загрузки пакета "gwascat" при попытке загрузить данные (ebicat37) я получаю следующее сообщение:

library(gwascat)

gwascat загружен. Используйте makeCurrentGwascat() для извлечения текущего изображения. от EBI. В папке данных этого пакета есть некоторые устаревшие выдержки.

data(ebicat37)

Предупреждение:

В данных (ebicat37): набор данных ebicat37 не найден.

В чем проблема и как исправить ошибку, так как мне нужно загрузить данные (ebicat37) для работы с каталогом GWAS, хранящимся в GRCh37.

Я добавил информацию о сеансе вместе с этим вопросом:

      sessionInfo()
R version 4.1.0 (2021-05-18)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 7 x64 (build 7601) Service Pack 1

Answer 1

Я заставил это работать:

1. используя старую версию R, конкретно 3.6.3; а также
2. удаление и переустановка более старой версии ( 1.30.16).

Примечание: вам будет предложено обновить, но не делайте этого. Используя эту старую версию BiocManager, вы можете затем установить и использовать ebicat37.