Нужна помощь в интерпретации кода ошибки мистера Байеса. «Для откалиброванных деревьев требуются совместимые тактовые частоты, но они несовместимы для прогона 1, цепочки 1.»
Я запускаю свой набор данных через г-на Байеса на XSEDE на CIPRES. Провели анализ без часов, все было в порядке. Затем провел анализ часов (модель окаменелости bd) с дополнительными ограничениями на ключевые клады (у меня есть морфологические данные, поэтому я сделал это, чтобы отразить академический консенсус, достигнутый с молекулярными данными). Затем я попытался откалибровать расхождение упомянутых ключевых клад, используя предполагаемые даты расхождения из молекулярного исследования.
Однако я получил код ошибки: «Для калиброванных деревьев требуются совместимые тактовые частоты, но они несовместимы для запуска 1, цепочки 1.»
Я попытался повторно запустить не-тактовый анализ с ограничениями клады, чтобы получить более информированное среднее значение тактовой частоты (результат этого был очень похож на первое значение тактовой частоты, которое я использовал). После этого я получил ту же ошибку в конце моего выходного файла:
Раздел 1 имеет 116 уникальных шаблонов сайтов. Инициализация условных правдоподобий. Использование стандартного калькулятора правдоподобия, отличного от SSE, для деления 1 (одинарная точность). ОШИБКА: для откалиброванных деревьев требуются совместимые тактовые частоты, но они несовместимы для прогона 1, цепочки 1. Ошибка в команде «Mcmc». произошла ошибка хотя бы на одном процессоре Ошибка при чтении char. 5-5 в строке 124 файла infile.nex
Возврат выполнения в командную строку ...
Ошибка в команде «Выполнить»
MrBayes> Удаление ранее определенных символов Удаление ранее определенных таксонов Выход из программы
Я понятия не имею, что не так. Все шло нормально, пока я не назвал даты расхождения для ключевых кладов. Мне нужна помощь в интерпретации кода ошибки. Я не уверен, что означают совместимые тактовые частоты.
(PS Пожалуйста, не исключайте, что я мог сделать что-то явно не так, я новичок в филогенетике в целом и иногда упускаю очевидное).