Извлечение временных рядов из базы данных AllenSDK ephy

Question

Я ищу библиотеку AllenSDK. Можно ли извлечь временной ряд (напряжение ячейки во времени) сделанных ими записей для оценки различных параметров? Я могу найти, как получить доступ к параметрам, но мне очень интересны их следы. Кто-нибудь может с этим помочь?

Answer 1

Пожалуйста, обратитесь к https://allensdk.readthedocs.io/en/latest/cell_types.html, чтобы получить набор данных и удобные метаданные. Затем вы можете получить доступ к таймсериям развертки следующим образом:

for sweep_number in sweep_numbers:
    data = dataset.get_sweep(sweep_number)
    v = data['response'] * 1e3 # mV
    i = data['stimulus'] * 1e12 # pA
    hz = data['sampling_rate']