Невозможно установить scanpy с помощью
Привет, у меня возникли проблемы с установкой библиотеки scanpy с помощью pip. Вот команда, которую я выполнил
pip install scanpy
Во время установки он сообщает следующее сообщение об ошибке:
Collecting scanpy
Downloading https://files.pythonhosted.org/packages/78/cf/b2cc01e9c33613d738c1cdeb5af7d250cf965bda187aa258e45ed25a6a15/scanpy-1.3.1.tar.gz (216kB)
|████████████████████████████████| 225kB 786kB/s
ERROR: Command errored out with exit status 1:
command: /home/john/Desktop/env2/bin/python2 -c 'import sys, setuptools, tokenize; sys.argv[0] = '"'"'/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py'"'"'; __file__='"'"'/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py'"'"';f=getattr(tokenize, '"'"'open'"'"', open)(__file__);code=f.read().replace('"'"'\r\n'"'"', '"'"'\n'"'"');f.close();exec(compile(code, __file__, '"'"'exec'"'"'))' egg_info --egg-base /tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/pip-egg-info
cwd: /tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/
Complete output (5 lines):
Traceback (most recent call last):
File "<string>", line 1, in <module>
File "/tmp/pip-install-vIOr01/scanpy/setup.py", line 2, in <module>
from pathlib import Path
ImportError: No module named pathlib
----------------------------------------
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.
2 ответа
Решение
Попробуйте запустить команду еще раз с pip3
. Если это не сработает, убедитесь, что у вас установлен Python 3 и вы используете соответствующую версию Pip. В этом отличном ответе подробно объясняется, как выполнить обновление, если у вас возникли трудности.
Я думаю, вы, возможно, запускали установку с использованием python 2, стоимость которого устарела с начала 2020 года. Вы пробовали запустить установку для python 3 с помощью pip3
вместо этого команду?
pip3 install scanpy