Генерировать n образцов, Отклонение выборки в R
Отбор проб
Я работаю с выборкой отклонения с усеченным нормальным распределением, см. Код r ниже. Как я могу остановить выборку на определенном n? например 1000 наблюдений. Т.е. я хочу остановить выборку, когда число принятых выборок достигло n (1000).
Какие-либо предложения? Любая помощь очень ценится:)
#Truncated normal curve
curve(dnorm(x, mean=2, sd=2)/(1-pnorm(1, mean=2, sd=2)),1,9)
#create a data.frame with 100000 random values between 1 and 9
sampled <- data.frame(proposal = runif(100000,1,9))
sampled$targetDensity <- dnorm(sampled$proposal, mean=2, sd=2)/(1-pnorm(1, mean=2, sd=2))
#accept proportional to the targetDensity
maxDens = max(sampled$targetDensity, na.rm = T)
sampled$accepted = ifelse(runif(100000,0,1) < sampled$targetDensity / maxDens, TRUE, FALSE)
hist(sampled$proposal[sampled$accepted], freq = F, col = "grey", breaks = 100, xlim = c(1,9), ylim = c(0,0.35),main="Random draws from skewed normal, truncated at 1")
curve(dnorm(x, mean=2, sd=2)/(1-pnorm(1, mean=2, sd=2)),1,9, add =TRUE, col = "red", xlim = c(1,9), ylim = c(0,0.35))
X <- sampled$proposal[sampled$accepted]
Как я могу установить длину X для определенного числа при выборке?
1 ответ
После сна, если вы решили использовать выборку отклонения и делать это только до тех пор, пока не пройдет 1000, я не думаю, что есть лучший вариант, чем просто использовать цикл while. Это значительно менее эффективно, чем
sampled$accepted = ifelse(runif(100000,0,1) < sampled$targetDensity / maxDens, TRUE, FALSE)
X <- sampled$proposal[sampled$accepted][1:1000]
Время, затраченное на приведенный выше код: 0.0624001s
, Время, необходимое для кода ниже 0.780005s
, Я включил его, потому что это ответ на конкретный вопрос, который вы задали, но этот подход неэффективен. Если есть другой вариант, я бы использовал это.
#Number of samples
N_Target <- 1000
N_Accepted <- 0
#Loop until condition is met
i = 1
sampled$accepted = FALSE
while( N_Accepted < N_Target ){
sampled$accepted[i] = ifelse(runif(1,0,1) < sampled$targetDensity[i] / maxDens, TRUE, FALSE)
N_Accepted = ifelse( sampled$accepted[i], N_Accepted + 1 , N_Accepted )
i = i + 1
if( i > nrow( sampled ) ) break
}