Конечная смесь твиди
Я пытаюсь оценить конечную смесь твидовых (или составных пуассоново-гамма) распределений. Я искал любые ресурсы, которые мог придумать, не найдя ресурсов о том, как это сделать.
В настоящее время я пытаюсь использовать пакет flexmix в R для написания другого M-пошагового драйвера, как описано в виньетке flexmix на страницах 12-14. Вот мой код, который опирается на пакет cplm:
tweedieClust <- function(formula = .~.,offset = NULL){
require(tweedie)
require(cplm)
require(plyr)
require(dplyr)
retval <- new("FLXMC", weighted = TRUE, formula = formula, dist = "tweedie",
name = "Compound Poisson Clustering")
retval@defineComponent <- expression ({
predict <- function(x, ...) {
pr <- mu
}
logLik <- function(x, y, ...){
dtweedie(y, xi = p, mu = mu, phi = phi) %>%
log
}
new("FLXcomponent",
parameters=list(coef=coef),
logLik=logLik, predict=predict,
df=df)
})
retval@fit <- function (x, y, w, component) {
fit <- cpglm(formula = y ~ x, link = "log", weights=w, offset=offset)
with(list(coef = coef(fit), df = ncol(x),mu = fit$fitted.values,
p = fit$p, phi = fit$phi),
eval(retval@defineComponent))
}
retval
}
Однако это приводит к следующей ошибке:
Ошибка в dtweedie(y, xi = p, mu = mu, phi = phi): бинарная операция на несоответствующих массивах
Кто-нибудь сделал или видел конечную смесь распределения твиди? Можете ли вы указать мне правильное направление для достижения этой цели, используя flexmix или иным способом?
1 ответ
Проблема где-то в части веса, если вы удалите ее, она работает:
tweedieClust <- function(formula = .~.,offset = NULL){
require(tweedie)
require(statmod)
require(cplm)
require(plyr)
require(dplyr)
retval <- new("FLXMC", weighted = F, formula = formula, dist = "tweedie",
name = "Compound Poisson Clustering")
retval@defineComponent <- expression ({
predict <- function(x, ...) {
pr <- mu
}
logLik <- function(x, y, ...){
dtweedie(y, xi = p, mu = mu, phi = phi) %>%
log
}
new("FLXcomponent",
parameters=list(mu=mu,xi=p,phi=phi),
logLik=logLik, predict=predict,
df=df)
})
retval@fit <- function (x, y, w, component) {
fit <- cpglm(formula = End~.,data=dmft, link = "log")
with(list(df = ncol(x), mu = fit$fitted.values,
p = fit$p, phi = fit$phi),
eval(retval@defineComponent))
}
retval
}
пример:
library(flexmix)
data("dmft", package = "flexmix")
m1 <- flexmix(End ~ .,data=dmft, k = 4, model = tweedieClust())