Загрузка NCBITaxa вылетает

Я уже давно использую модуль ete2 на очень мощных серверах. Все было хорошо, пока он не начал идти очень медленно (один get_taxid_translator() функция в минуту), теперь я даже не могу пройти ncbi = NCBITaxa() назначение. Я удалил и переустановил anaconda2, попытался обновить до ete3, все отлично работает на наших "серверах разработки", но все еще не могу пройти ncbi = NCBITaxa() Линия в любой части программного обеспечения на наших обычных серверах. Даже следующий скрипт не завершается

    #!/usr/bin/env python
    from ete3 import NCBITaxa

    ncbi = NCBITaxa()

    print "Finished"

Это случилось с кем-то еще? Нужно ли понижать какие-либо зависимости? Может ли это быть проблема с разрешениями? Когда я запускаю базовый сценарий, Ctrl + C, ни Ctrl + Z не выйдет из сценария, и я должен использовать kill -9 <job-id> убить сценарий. Если я жду слишком долго, процесс переходит в непрерывный сон.

Заранее спасибо, Алексис.

Python 2.7.12:: Anaconda custom (64-bit) gcc (GCC) 5.4.0

0 ответов

Другие вопросы по тегам