Пропорциональное допущение опасности Коксме
Я использую модели Кокса со смешанным эффектом, использующие функцию Кокса {coxme} в R, и я хотел бы проверить предположение о пропорциональной опасности.
Я знаю, что предположение PH может быть проверено с помощью функции cox.zph {выживание} на модели cox.ph.
Однако я не могу найти эквивалент для моделей Коксме.
В 2015 году аналогичный вопрос был размещен здесь, но не получил ответа.
Мои вопросы: 1) Как проверить предположение PH на модели Кокса со смешанным эффектом? 2) если для моделей coxme не существует эквивалента cox.zph, допустимо ли для публикации в научной статье запускать модель coxme со смешанным эффектом, но проверять допущение PH для модели cox.ph, идентичной модели coxme, но без случайного эффекта?
Заранее спасибо за ваши ответы. С уважением
1 ответ
Ты можешь использовать frailty
вариант в coxph
функция. Допустим, ваша переменная случайного эффекта B
, ваша фиксированная переменная эффекта A
, Тогда вы подходите вашей модели, как показано ниже
myfit <- coxph( Surv(Time, Censor) ~ A + frailty(B) , data = mydata )
Теперь вы можете использовать cox.zph(myfit)
проверить пропорциональное допущение опасности.
У меня недостаточно репутации, чтобы комментировать, но я не думаю, что использовать
frailty
вариант в
coxph
функция будет работать. в
cox.zph
документация, в ней говорится:
Термины случайных эффектов, такие как неустойчивость или случайные эффекты, в модели Коксма не проверяются на пропорциональные опасности, а рассматриваются как фиксированное смещение в модели.
Таким образом, он не принимает во внимание случайные эффекты при проверке предположения о пропорциональных рисках.