Как правильно обновить пустой объект ete3.Tree с помощью отформатированной строки дерева newick [Python]?
Я создаю класс, который наследует от ete3.Tree
, Я хочу добавить newick
отформатировал строку для объекта, но я не могу найти правильный способ обновления объекта. я хочу t2
ниже, чтобы быть такой же структурой, как t1
и под структурой я имею в виду быть таким же, как я построить t2
возражать, как я t1
но из пустого ete3.Tree
объект.
import ete3
newick = "(((petal_width:0.098798,petal_length:0.098798):0.334371,sepal_length:0.433169):1.171322,sepal_width:1.604490);"
t1 = ete3.Tree(newick=newick, name="hello")
t2 = ete3.Tree(name="hello")
t2.add_child(child=ete3.Tree(newick))
print(t1 == t2)
print(t1.__dict__)
print()
print(t2.__dict__)
# False
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514b1c), Tree node 'sepal_width' (0x12aeb4a9)], '_up': None, '_dist': 0.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
# {'_children': [Tree node '' (-0x7fffffffed514ba1)], '_up': None, '_dist': 1.0, '_support': 1.0, '_img_style': None, 'features': {'dist', 'support', 'name'}, 'name': 'hello'}
Как я могу это сделать? Я понимаю, что они не будут одинаковыми хэшами, кроме _children
атрибут выглядит по-разному между 2 экземплярами.
Python version 3.6.4
ete3 version: 3.1.1