Описание тега system2

Вопросы с тегом
0 ответов

Синтаксис R system2 в Linux

Моя проблема с синтаксисом system2. Я пытаюсь переименовать filenameA в filenameB в linux. но мне нужно использовать полные пути, и переименование не нравится, поэтому я предлагаю использовать "mv". Я планирую использовать system2 и "mv" (в конце ко…
17 май '17 в 18:54
1 ответ

Использование system2() в R для запуска скомпилированного файла cpp

Я пытаюсь запустить скомпилированный файл cpp в моей R-программе, используя system2(). Документация для cpp предполагает, что это всего лишь одна большая команда, поэтому я думаю, что я не должен использовать опции stdout или stder в sys2. необходим…
25 июн '18 в 13:52
5 ответов

Системные функции R всегда возвращают ошибку 127

Мне нужно выполнить внешний инструмент из R и ошибки процесса (если таковые имеются) произошли в этом инструменте. Я знаю 3 функции, чтобы сделать что-то знакомое с моей задачей: shell, system and system2. Что бы проверить их, я вижу эту команду she…
11 ноя '15 в 08:37
0 ответов

Выполнение команд командной строки в R

Я пытаюсь выполнить некоторые команды Linux из сценария R. Я использую R версии 3.3.1 и system а также system2 не доступны для этой версии. Есть ли другое решение для этого?
27 июл '16 в 16:33
1 ответ

R system2 проблема, вызывающая R скрипт на windows

Я часто использую RODBC для соединения с базами данных Microsoft Access и могу делать это только в 32-битном R, потому что 32-битный MS Office загружен на моем компьютере с Windows 7. После извлечения моих данных из базы данных MS Access в 32-битном…
14 май '15 в 22:34
1 ответ

Передать вывод из system2 в объект R

Я пытаюсь получить вывод из двоичного файла с аргументами, вызываемыми system2, в объект R. Но я терплю неудачу. Я гуглил несколько альтернатив, таких как system, exec_internal, но не могу понять это правильно. Вот игрушечный пример, использующий фу…
26 июл '17 в 10:50
1 ответ

Различные результаты для одной и той же функции при параллельном вычислении R

У меня проблема с вызовом внешнего пакета с использованием функции system2 с параллельной библиотекой под Windows 10, моя функция выполняет внешнюю программу для чтения двоичного файла (содержимое должно быть в той же папке, что и в примере). Пробле…
08 фев '18 в 20:02
1 ответ

R system2 запускает разные скрипты параллельно

Я считаю, что использование system2() является хорошим вариантом для параллельного запуска двух R-скриптов. Я пытаюсь что-то вроде следующего: Sys.time() system2(command = 'Sys.sleep(5)', wait = FALSE) system2('Sys.sleep(7)', wait = FALSE) Sys.time(…
26 окт '18 в 04:24
1 ответ

system2 функционирует в R

Когда я запускаю командный файл через system2 в R: Следующее запускает пакетный файл без каких-либо проблем: system2("Run.bat") Тем не менее, этот дает ошибку: system2("Run", stdout=stdout, stderr=stderr) Warning message: running command '"Run.bat"'…
24 окт '14 в 19:05
1 ответ

R purrr system2 map

У меня есть вектор имен файлов A, и у меня есть эквивалентный вектор новых имен для этих файлов - B. Я надеялся сделать: test <-map2(A, B, ~system2('mv', args=c(.x, .y))) или возможно test <-map2(A, B, ~system2('mv', args=paste(.x, .y))) но.x …
17 май '17 в 21:34
0 ответов

Вызов Java из R с использованием System2 и Status 127

Я использую RStudio на Windows. system2("java C:/myClass", args = as.character(myVector)) Warning message: running command '"java C:/myClass" 1 1 1' had status 127 Насколько я понимаю, это должно означать, что командная строка не может распознать мо…
28 июн '14 в 16:39
3 ответа

Невозможно получить результат команды system language R

Я не могу получить результат system2. попытался выполнить образец файла JAR. execute_system.R: workingDir <- "C:/Code" setwd(workingDir) command <- "java -jar sample.jar 674" commandResult <- system2(command, stdout="C:/Code/stdout.txt", st…
16 июн '16 в 13:24
1 ответ

Перенаправить стандартный вывод system2 в файл в Windows

Согласно инструкции, stdout аргумент system2 Функция может перенаправить вывод в файл. Кажется, это работает на Unix, однако я не могу заставить его работать на Windows. Пример игрушки ниже, нет out.txt или же err.txt файлы созданы. Я попытался отпр…
14 июл '13 в 09:19
0 ответов

Команда system2 не найдена

Я пытаюсь подсчитать количество слов в файле твиттера, используя выражение system2("wc", args = "-w final/en_US/en_US.news.txt",stdout=TRUE) Я продолжаю получать сообщение, что Ошибка в system2("wc", args = "-w final/en_US/en_US.news.txt", stdout = …
16 мар '16 в 05:02
0 ответов

R Подождите, пока исполняемый файл системы не будет завершен

Я пытаюсь запустить серию входных файлов (расположенных в моей папке C:/GenSoftware/Colony/datFiles/) через исполняемый файл Colony2.exe, который находится в моей папке C: / GenSoftware / Colony /. Я пытаюсь переименовать файл 1, скопировать его в т…
04 фев '14 в 19:25
0 ответов

system2 не сохраняет вывод командной строки Java в файловую систему, создается только вывод в консоли

Я пытаюсь запустить приложение Java (beagle2vcf) из R. Я пробовал с system() но никакие прогоны не выполняются, только помощь функции возвращается в консоли R. Но когда я копирую ту же команду в мой cmd консоль бег выполняется. Тогда я пытаюсь с sys…
20 май '19 в 10:16
0 ответов

Ищите решение для R system2("powershell", args = readClipboard()), возвращая 127

У меня есть неловкая проблема, что при выполнении определенной команды powershell (вызов модуля powershell, расположенного в ~/WindowsPowerShell/Modules/) в R через system2(command = 'powershell', args = someStringVariable) он вернет только "127". Д…
15 июл '19 в 21:10
0 ответов

Есть ли способ "перезагрузить" (не перезапустить) консоль RStudio - б / у проблемы с командой system2

У меня проблема в том, что моя консоль RStudio (1.1.456) (R-3.4.2), похоже, заболела именно при работе system2 команда на WINDOWS 10 Enterprise. Это функция, которая работала пару дней назад. Общее описание проблемы - пожалуйста, не ожидайте здесь р…
16 июл '19 в 21:06
0 ответов

Как правильно использовать функцию system2

Я пишу скрипт для анализа данных, в котором использую функцию system2. Я должен надеяться, что моя функция в порядке. Моя функция возвращает проблему: Class 'try-error' atomic [1:1] Error in system2(file.path(script.dir, "script1.sh"), c(matlab.dir,…
04 сен '19 в 18:46
1 ответ

R system или system2 с использованием paste или sprintf для запуска файла bat?

У меня есть файл bat, который я могу запустить из R с помощью следующей системной команды: system('"C:\\PROGRA~1\\THERMO~1\\AFFYME~1\\APT-12~1.5\\bin\\apt-vars.bat" && cd "C:\\Users\\phyca\\Desktop\\R7\\R7_10-~1" && apt-cel-convert.e…
30 окт '19 в 01:16