Описание тега ruffus
Ruffus - это библиотека вычислений для Python. http://ruffus.readthedocs.io/en/latest/
2
ответа
Может ли Pweave хорошо играть с Руффусом?
Я заинтересован в разработке самодокументируемых трубопроводов. Могу ли я обернуть задания Руффуса в куски Pweave? Pweave and Ruffus ============================================================== **Let's see if Pweave and ruffus can play nice** <…
09 янв '12 в 17:08
1
ответ
Трубопровод Ruffus с внутренними входами
Я хотел бы создать конвейер с пакетом Ruffus для Python, и я борюсь с его простейшими концепциями. Две задачи должны быть выполнены одна за другой. Второе задание зависит от выхода первого задания. В документации Ruffus все предназначено для импорта…
08 авг '16 в 15:26
1
ответ
При использовании библиотеки Ruffus в Python 2.7 флаг just_print не работает
У меня есть конвейер ерша в Python 2.7, но когда я вызываю его с -n или же --just_print он по-прежнему выполняет все текущие задачи, а не просто печатает конвейер, как это должно быть. Я:* нет -n аргумент, который заменит встроенный (хотя у меня ест…
16 янв '17 в 19:18
0
ответов
Конвейер make-файлов Python с использованием Ruffus
Я пытаюсь передать несколько скриптов с помощью Python Framework, используя Ruffus. У меня есть несколько файлов.cpp и.h из моего файла main.cpp. Мой make-файл отлично работает в оболочке. Как можно создать конвейер на основе Python, используя Ruffu…
25 фев '16 в 17:40
1
ответ
Как использовать подкаталоги с конвейерами Ruffus
Документация конвейера Ruffus, похоже, предполагает, что код и данные находятся в одном каталоге. Все примеры имеют спецификаторы входных и выходных файлов без относительных путей. Как изменить синтаксис ниже, если, скажем, файлы для преобразования …
28 май '15 в 22:30
0
ответов
Как сделать обновление на var python / Ruffus
Я новичок в области биоинформатики и начинающий Python. Я использую фреймворк под названием Ruffus для запуска конвейера, заставляющего файлы перемещаться по инструментам для получения интересного результата. В части моего конвейера (3-й шаг) мне ну…
27 окт '17 в 14:43
1
ответ
Требуется сделать набор файлов перед запуском функции в конвейере Ruffus
Я использую Ruffus, чтобы написать конвейер. У меня есть функция, которая вызывается параллельно много раз, и она создает несколько файлов. Я хотел бы сделать функцию "combFiles()", которая вызывается после того, как все эти файлы были сделаны. Поск…
17 мар '10 в 21:11