Описание тега i2b2

Вопросы с тегом
По вопросам, связанным с архитектурами клиент / сервер i2b2, используемыми для настройки i2b2 (Информатика для интеграции биологии и у постели больного) или для разработки расширений для i2b2 (например: построение схемы базы данных, загрузка данных базы данных, настройка онтологии, архитектуры кустов / ячеек, конфигурация JBoss, Apache/ Настройка IIS, настройка Axis, настройка Java, расширение / настройка i2b2 и т. Д.).
2 ответа

Последовательный запуск файлов *.sql из XML-файла с помощью команды ant (создание базы данных онтологии i2b2 на SQL Server 2008 Express)?

Ниже приведены команды из учебника по настройке базы данных i2b2 для создания набора таблиц и загрузки данных для конкретной базы данных. Я только запускал команды *.sql вручную (в новом окне запросов) в SQL Server Management Studio (SSMS). Это то, …
06 май '12 в 09:38
1 ответ

Затмение: папка пути к классам Java отсутствует в проекте, но существует в структуре каталогов Windows для проекта

Я новичок в "Затмении", так что держись со мной. Я загрузил исходный код Java сервера приложений с сайта i2b2.org и скомпилировал его для развертывания. Это приложение работает поверх JBoss. В рабочей области есть 8 папок проектов, на которые я пере…
04 окт '12 в 15:34
0 ответов

Eclipse Java Libraries для i2b2 Workbench

Я пытаюсь установить и скомпилировать исходный код для интерфейса i2b2 Workbench с исходным кодом. По ряду причин мой работодатель хочет использовать более старую версию Workbech, которую можно найти здесь: https://www.i2b2.org/software/archive.html…
04 фев '19 в 17:59
1 ответ

Два экземпляра одного и того же приложения на JBoss выдают это исключение: java.lang.Exception: порт 8083 уже используется

На Windows Server 2008 я пытаюсь запустить два экземпляра одного и того же приложения. Это приложение (i2b2) использует веб-сервисы Apache Axis 2. Веб-сервисы JAX-WS работают на порту 9090 и вызывают исходный код нашего приложения на JBoss на порту …
18 мар '13 в 21:02
1 ответ

Проверка шага установки PM в i2b2 не работает

Я выполнил все шаги, упомянутые в главе 5 документации по установке PM, которую можно найти здесь. Я на шаге 5.7 Проверка шага установки PM. И когда я запускаю следующий URL, как указано в документации http://localhost:9090/i2b2/services/listService…
14 июн '16 в 18:57
1 ответ

Регулярное выражение Textpad: заменить группу из 3 символов на 5 новых строк

Я хочу украсить код SQL с помощью этого инструмента. Прежде чем этот инструмент примет его, я хочу заменить каждый экземпляр "<*>" (исключая двойные кавычки) на "\n\n\n\n\n" (5 новых строк) в TextPad, используя функцию "Заменить" и выбрав Регулярное…
12 июл '12 в 00:43
1 ответ

Страница JSP Tomcat 7: избегайте 500 ошибок при аутентификации в Tomcat с использованием сеанса аутентификации Shibboleth

Tomcat 7 Исключение: Apache Tomcat / 7.0.63 - HTTP Status 500 - Возникла исключительная ситуация при обработке страницы JSP Ссылка: Я интегрировал этот код с нашим приложением i2b2, чтобы мы могли проходить проверку подлинности с помощью нашего Shib…
11 окт '15 в 05:58
1 ответ

Более быстрый способ поиска дубликатов в SQL Server

Я пытаюсь найти лучший способ поиска дубликатов в SQL Server. Это заняло более 20 минут, чтобы запустить чуть более 300 миллионов записей, прежде чем результаты начали отображаться в окне результатов в SSMS. Прошло еще 22 минуты, прежде чем он рухну…
02 май '13 в 17:52
4 ответа

Что означает этот JavaScript?

Я работаю над устаревшим приложением, и все JS кажутся мне загадочными.Вот несколько загадочных строк, которые загружаются раньше всех, и я понятия не имею, что они делают. var i2b2 = {sdx:{TypeControllers:{},Master:{_sysData:{}}},events:{},hive:{cf…
11 авг '11 в 09:17
1 ответ

Выполнение Java-программы (NCBO Extraction Tool) из командной строки Windows не работает... Руководство пользователя использует синтаксис Linux

Я пытаюсь запустить программу командной строки Java из командной строки Windows, чтобы извлечь и сгенерировать файл онтологии из BioPortal (http://bioportal.bioontology.org). Кажется, что он не может найти класс, но, возможно, мой синтаксис параметр…
04 янв '13 в 19:17
1 ответ

Как я могу получить статистические значения без повторения первого столбца в группе по предложению?

Этот запрос заставляет меня помещать f.CONCEPT_CD в предложение group by, потому что я использую его в операторах case в предложении select. Как сохранить счет в наборе результатов, не повторяя записи с одинаковым значением f.PATIENT_NUM? Обратите в…
17 апр '13 в 00:27
0 ответов

HiTex i2b2 верстак НЛП вид

Я скачал и запустил i2b2 Workbench для Windows 2.0.01. Я вхожу в i2b2 со следующей информацией: Target location: i2b2demo username: demo password: demouser Согласно следующей документации https://www.i2b2.org/software/files/PDF/current/NLP_Installat…
15 дек '17 в 13:21
1 ответ

Hive-rlike не возвращает результаты, отвечающие нескольким условиям

Я рассчитываю на повторные встречи позднее 17.12.2020 для каждого пациента, связанного с любым из антибиотиков. Я ожидаю много результатов, как показывает мне запрос по одному антибиотику за раз. Но когда я связываю их вместе в rlike, он возвращает …
09 янв '22 в 15:31