Описание тега cowplot
Пакет cowplot - это простое дополнение к ggplot2. Он предназначен для предоставления темы для ggplot2, которая особенно полезна для форматирования графиков для публикации в академических журналах, а также предоставляет инструменты для аккуратного упорядочивания нескольких графиков разных типов, сводя к минимуму количество необходимых манипуляций с размерами меток осей, графика фоны и др.
1
ответ
Объединение графиков рассеяния
Я пытаюсь объединить несколько (четыре) диаграммы рассеяния в одну фигуру (но не матрицу диаграммы рассеяния). Я делаю отдельные точечные графики с scatterplot() функция car пакет. Раньше я мог комбинировать четыре графика, используя либо layout() и…
23 май '18 в 21:10
1
ответ
Вставить изображение /PNG ggplot2 - Cowplot
Я пытаюсь использовать пакет cowplot draw_image() функция. Мне удалось получить изображение на графике в качестве примера. Я не могу понять, как работают координаты xy, мне приходилось вводить случайные числа, пока я не увидел изображение. require(g…
19 дек '18 в 13:37
1
ответ
cowplot plot_grid автоматически уменьшает размер графиков
Я пытаюсь сделать PDF с серией из 25 графиков, расположенных в 6 столбцах, используя cowplot функция plot_grid, Я бы хотел, чтобы они отображались в том же размере, что и при наличии только одного ряда. По некоторым причинам, хотя размер графиков ст…
25 фев '19 в 10:26
1
ответ
Добавление меток к участкам в cowplot::gridplot в R
Я строю несколько фигур с использованием сетки, как показано ниже. p.list <- list() for (i in 1:length(paths)){ p <- plotQC(get(paste0("sce_",i)), type = "highest-expression") p.list[[i]] <- p } cowplot::plot_grid(plotlist = p.list) Как доб…
27 дек '18 в 16:50
1
ответ
rel_heights в plot_grid не отвечает
У меня два ggplotЯ пытаюсь собрать с помощью cowplot"s plot_grid: Первый data.frame а также ggplot: require(ggplot2) main.df <- data.frame(sample=c(paste("E.plus.A.plus",1:3,sep="_"),paste("E.minus.A.plus",1:3,sep="_"),paste("E.plus.A.minus",1:3,…
31 дек '16 в 03:33
1
ответ
Изменить настройки по умолчанию для темы Cowplot
Мне нравится тема по умолчанию для cowplot, но я хочу внести некоторые изменения. Например, я хотел бы иметь возможность настроить значение по умолчанию для legend.key, MWE, library(ggplot2); library(cowplot) plt = ggplot(mtcars, aes(x = mpg, y = wt…
31 май '17 в 12:46
1
ответ
Объединяя мурлыканье и коровник для создания сетки сюжета
Я создал список столбца ggplot2 цифры, использующие purrr и теперь я хотел бы использовать cowplot::plot_grid() объединить их в один сюжет. Как я могу это сделать? Существует грубый способ сделать это, но он может не сработать, если я априори не зна…
12 мар '18 в 17:25
0
ответов
Объединение графиков и перекрывающихся объектов geom_rect с использованием ggplot2 и cowplot
Я собираюсь подвести итог некоторым вопросам, заданным ранее на этом форуме ( 1, 2), но в данном случае с моими реальными наборами данных и кодами, все вместе. Я застрял и мне нужна помощь, чтобы узнать, как правильно его кодировать. Давайте начнем …
30 май '18 в 18:40
0
ответов
Маскировка коровника ggplot2 даже после отсоединения
У меня проблема с cowplot как я создал несколько графиков, используя ggplot но как только я загружаю cowplot Я больше не могу получить тот же сюжет, перезапускающий скрипт ggplot. Я оторвался cowplot с помощью detach(package:cowplot) и когда я ищу е…
29 ноя '17 в 20:41
1
ответ
Функция draw_image() из cowplot приводит к размытым PDF-файлам
Чтение векторизованного PDF иногда приводит к получению сильно размытого изображения с draw_image() функция из коровьего участка: library(ggplot2) library(cowplot) library(magick) # make pdf input as example p <- ggplot(iris, aes(Sepal.Length, Se…
25 апр '18 в 16:11
1
ответ
R 'cowplot' аккуратно создает сеточный сюжет с общими (общими) легендами и уникальными легендами
Смотрите мой связанный вопрос и принятый ответ здесь. Я пытаюсь создать сюжет, похожий на сюжет в принятом ответе, то есть сюжет в сетке с общей общей легендой и уникальной легендой, прикрепленной к каждому графику в сетке. В частности, я хочу сетку…
20 окт '17 в 10:32
1
ответ
Извлечение отдельных подробностей сюжета из комбинированного сюжета в "коровнике" для юнит-тестов
Я пытаюсь написать модульные тесты для функций, где я использую cowplot::plot_grid() комбинировать ggplot2 участки. Например, # setup set.seed(123) library(ggplot2) # creating basic plots p1 <- ggplot(aes(x = as.factor(am), y = wt), data = mtcars…
05 янв '19 в 11:34
1
ответ
Настраиваемая ширина оси с темой после загрузки cowplot
Я пытаюсь сделать линии осей X и Y толще, используя theme(axis.line=element_line(size=2)) но коровник переопределяет это. Есть ли способ указать размер линий оси XY при использовании cowplot? Я пытался добавить theme(axis.line=element_line(size=2)) …
17 янв '19 в 22:03
2
ответа
Соединение дендрограммы и тепловой карты
У меня есть heatmap (экспрессия гена из набора образцов): set.seed(10) mat <- matrix(rnorm(24*10,mean=1,sd=2),nrow=24,ncol=10,dimnames=list(paste("g",1:24,sep=""),paste("sample",1:10,sep=""))) dend <- as.dendrogram(hclust(dist(mat))) row.ord &…
05 фев '17 в 02:17
1
ответ
Как сделать несколько графиков на одной странице в R, используя пакет cowplot?
Я использую встроенный набор данных радужной оболочки в R, я хочу построить несколько графиков на той же странице, для которой я использую пакет cowplot. Однако проблема, с которой я сталкиваюсь, состоит в том, что метки на рисунках i, e "A" и "B" п…
11 окт '18 в 06:09
1
ответ
extrafont и showtext: arial невозможен для фигуры eps
У меня тот же вопрос, что и Ошибка при использовании Arial на рисунке.eps с пакетом extrafont, но ответы мне не помогли: я использую ggplot2 и cowplot для создания фигур. Журнал, в котором я хочу опубликовать, хочет получить eps-файл с шрифтом arial…
29 янв '16 в 09:28
0
ответов
Общая граница панели с cowplot и plot_grid
Я пытаюсь нарисовать границу вокруг двух графиков, которые были выровнены с plot_grid из пакета cowplot. Пожалуйста, смотрите следующий пример (модифицированный из виньетки "Изменение положения оси"): require(gtable) require(cowplot) # top plot p1 &…
23 мар '16 в 00:24
1
ответ
Несколько графиков для игнорирования цикла
Я пытаюсь сгенерировать 10 пар графиков с несколькими парами на страницу графиков, и я использую for цикл для построения пар. Однако графики отправляются на устройство в виде отдельных графиков, а не страниц. MWE ниже имеет идентичные конструкции дл…
19 июн '18 в 13:09
2
ответа
Вертикальное выравнивание графиков разной высоты с использованием cowplot::plot_grid() при использовании ordin_equal()
Я пытаюсь объединить два объекта ggplot, используя cowplot::plot_grid() и вертикально выровнять их. Обычно это довольно просто, используя align = "v", dat1 <- data.frame(x = rep(1:10, 2), y = 1:20) dat2 <- data.frame(x = 1:10, y = 1:10) plot1 …
22 фев '18 в 09:48
1
ответ
Уменьшить запас пустого пространства в заговоре
Данные и библиотеки, использованные для этого вопроса: library(tidyverse) library(reshape2) library(cowplot) data("diamonds") temp1_m <- temp2_m <- melt(diamonds[1:3]) temp1_m[3] <- temp2_m[3] <- NULL colnames(temp1_m) <- colnames(tem…
17 май '18 в 21:08