Описание тега burrows-wheeler-transform
Burrows-Wheeler is an algorithm used in data compression.
5
ответов
Преобразование Берроуза-Уилера (BWT) - сохраненные данные
После использования BWT, какой набор данных нам нужен в закодированных данных? Нужно ли кодировать (или экспортировать) суффиксный массив? Входные данные: stackru BWT выход: wtavrcfkle$soo Суффиксный массив: 13, 2, 3, 7, 9, 4, 10, 5, 11, 8, 0, 1, 6,…
03 май '13 в 17:52
1
ответ
Используется ли сортировка по основанию для сортировки суффиксов?
Я пытаюсь реализовать сортировку блоков. Это из бумаги Берроуз Уилер. (Перед этим шагом вы создаете массив суффиксов V из S) Q4. [радикальная сортировка] Сортируйте элементы V, используя первые два символа каждого суффикса в качестве ключа сортировк…
15 июн '11 в 03:26
2
ответа
Анализ строки перед преобразованием Барроуза-Уилера?
Если мы рассмотрим это aaabccba как наша входная строка, baaacacb будет выходной строкой после применения преобразования Берроуз-Уилера на входе. наблюдая за выходом, вы увидите, что два слипались c отделены. Понятно, что входная строка даст лучшее …
23 июн '13 в 09:50
1
ответ
Сжатие и декомпрессия текста с использованием BWT
Я хочу спросить, можем ли мы объединить алгоритмы BWT MTF и Хаффмана, чтобы получить более высокую степень сжатия в Java? какой будет процесс? Ошибка в записи файла MTF? public class MTF{ static File f=new File("MTF.txt"); public static File encode(…
31 дек '17 в 06:15
1
ответ
Burrows Wheeler Transformation - Вектор преобразования
После преобразования входного текста "abracdabra!" Мой вектор преобразования будет [3, 0, 5, 6, 7, 9, 10, 8, 2, 1, 4], затем текст будет передан через несколько дополнительных преобразований и сжатый на диск. После закрытия программы у нас, очевидно…
23 окт '12 в 21:19
1
ответ
Обратный BWT, не зная последний символ
Обычно в алгоритме преобразования Берроуза-Уилера символ $ используется для обозначения конца строки, но во многих случаях этот $ опускается. Мне было интересно, как его можно повернуть вспять, не зная позиции последнего персонажа? Например, у меня …
22 апр '16 в 16:04
0
ответов
Сжатие изображений с использованием Burrows Wheeler Transform
У меня есть код для кодирования и декодирования текстового файла с использованием Burrows Wheeler Transform (BWT). Но в этом случае я хочу кодировать и декодировать изображение. Пожалуйста, дайте мне решение преобразовать изображение в строку, чтобы…
02 сен '14 в 01:00
1
ответ
Обратное преобразование Барроуза-Уилера
Я реализовал прямое преобразование преобразования Берроуза-Уилера (BWT). Теперь проблема в том, что я не могу понять обратное. Рассмотрим р: p = [3 2 5 3 1 4 2 6] Форвард BWT: fbwt = [3 3 4 5 6 1 2 2] index = 5 Обратный путь: Пожалуйста, кто-нибудь,…
19 сен '14 в 14:21
1
ответ
Дистанционное кодирование (DC) BWT
Я пытаюсь написать BWT с программой сжатия Хаффмана с Java. В BWT я хочу реализовать дистанционное кодирование (DC). Я ищу несколько примеров, но их не так много. Я нашел этот пример: http://www.cs.ucr.edu/~stelo/cpm/cpm07/move_to_front_gagie.pdf ДК…
18 мар '12 в 17:16
3
ответа
Burrows Wheeler Transform (BWT)
У меня возникают трудности с пониманием алгоритма декодирования для преобразования Берроуза Уилера (BWT). Я закончил читать онлайн и просмотрел некоторый пример кода, но все они, похоже, используют "первичный индекс" для декодирования закодированной…
07 май '11 в 11:23
1
ответ
Почему максимальный размер блока bzip2 составляет 900 КБ?
bzip2 (то есть эта программа Джулиана Сьюарда) перечисляет доступные размеры блоков от 100 до 900 тысяч: $ bzip2 --help bzip2, a block-sorting file compressor. Version 1.0.6, 6-Sept-2010. usage: bzip2 [flags and input files in any order] -1 .. -9 se…
08 фев '18 в 07:02
0
ответов
Как реализовать немного калькулятор в Python 2?
Моя строка 'GATTACA$' и BWTreverse этого 'ACTGA$TA'. Я получаю 64 бита для обоих, и я не уверен, что это правильно, так как это должно быть совместно введено описание изображения здесь сжато.
14 фев '18 в 23:18
1
ответ
Какой алгоритм наиболее подходит для преобразования Берроуза-Уилера?
Кажется, многие компрессоры, реализующие BWT, используют его в сочетании с арифметическим кодированием или кодированием Хаффмана. (Не стесняйтесь выдвигать больше, особенно если они лучше.) Мой первый вопрос: почему словарный кодер, такой как LZW ил…
31 мар '13 в 10:24
1
ответ
Инструмент BWA с потоковой передачей
Burrows-Wheeler Aligner(BWA), биоинформационный инструмент (алгоритм) для сопоставления коротких нуклеотидных последовательностей с эталонным геномом. Я пытался запустить BWA с использованием потоковой передачи Hadoop, но получил ошибку. Команда: ha…
23 янв '14 в 06:45
1
ответ
Быстрое внедрение BWT в Lua
local function fShallowCopy(tData) local tOutput = {} for k,v in ipairs(tData) do tOutput[k] = v end return tOutput end local function fLexTblSort(tA,tB) --sorter for tables for i=1,#tA do if tA[i]~=tB[i] then return tA[i]<tB[i] end end return fa…
14 май '16 в 15:18
1
ответ
Изменение и добавление в список в Haskell
Я реализую Преобразование Берроуза-Уилера в Хаскеле. Комбинация всех циклических строк генерируется и сохраняется в матрице в качестве первого шага преобразования. Я использую Haskell List для построения матрицы. Список будет хранить исходное слово …
26 апр '16 в 14:55
0
ответов
Индекс списка Python вне диапазона при выполнении обратного BWT
Я пытаюсь передать блоки текста в обратную функцию Burrows-Wheeler Transform из текстового файла, и я получаю индекс списка из ошибок диапазона, не знаю почему. Я читаю текстовый файл, к которому применен BWT, разбив его на блоки размера block_size …
13 май '16 в 00:06
2
ответа
Как отсортировать суффиксы массива при сортировке блоков
Я читаю алгоритм сортировки блоков из статьи Барроуза и Уилера. Это шаг алгоритма: Предположим, S= абракадабра Инициализируйте массив W из N слов W[0, ..., N - 1], так что W[i] содержит символы S'[i, ..., i + k - 1], расположенные так, чтобы сравнен…
14 июн '11 в 23:45
2
ответа
Рекурсивно создавать все повороты строки в Scala
Я пытался воссоздать пример преобразования Барроуза-Уилера в Википедии. Чтобы добавить к веселью, я пытаюсь сделать это с помощью рекурсивной стратегии. Тем не менее, я застреваю на первом этапе, создавая все повороты строки. Вот мой код: object Sim…
27 ноя '12 в 18:14
2
ответа
Эффективно ли применять преобразование длины прогона после перемещения к переднему преобразованию и BWT?
Я новичок в кодировании, поэтому я пытаюсь понять основы. Я наткнулся на документ, описывающий технику сжатия текста без потерь, и в этом документе была фигура, иллюстрирующая, как работает их сжатие. Это работает так: Source -> BWT -> MTF -&g…
25 дек '12 в 01:18