Функция для применения идентификатора к узлам в дендрограмме

Question

Я хотел бы знать, есть ли функция, которая применяет идентификатор ко всем узлам в данной дендрограмме (двоичное дерево).

Поэтому я хочу функцию, которая после этого на данном дереве будет делать следующее:

attr(tr,"ID")             ## should give 1   or  1 

attr(tr[[1]],"ID")        ## should give 2  or 10

attr(tr[[2]],"ID")        ## should give 3  or 11

attr(tr[[c(1,1)]],"ID")   ##  should give 4  or 100

так далее...

И, если дано, чтобы начать с binaryID 110 (идентификатор главного узла)

это 1-й ребенок ID должен быть 1100, это 2-й ребенок ID должен быть 1101

Заметка: - dendrapply() применяет функцию ко всем узлам дерева

Пакет с использованием = "статистика"

 D=rbind(
+ c(1,1,1,1,1),
+ c(1,2,1,1,1),
+ c(2,2,2,2,2),
+ c(2,2,2,2,1),
+ c(3,3,3,3,3),
+ c(3,3,3,3,2))

Ddend=as.dendrogram(hclust.vector(D))

funID<-function(tr,StartID){
 .....
 attr(n,"ID")= ID  # for all the nodes in tr
 }

Что будет с funID?

Answer 1

Это код взят из stats:::reorder.dendrogram и модифицировано, чтобы соответствовать метке корня и каждого листа с возрастающим целым числом. Это может не совсем соответствовать вашим спецификациям, но посмотрите, подходит ли это...

label.leaves <- 
 function (x, wts) 
 { N=1
     if (!inherits(x, "dendrogram")) 
         stop("we require a dendrogram")
     oV <- function(x, wts) {
         if (is.leaf(x)) {
             attr(x, "ID") <- N; N <<- N+1
             return(x)
         }
         k <- length(x)
         if (k == 0L) 
             stop("invalid (length 0) node in dendrogram")
         vals <- numeric(k)
         for (j in 1L:k) { N <- N+1
             b <- oV(x[[j]], wts)
             x[[j]] <- b
             vals[j] <- N; N <- N+1
         }
       x
     }
     stats:::midcache.dendrogram(oV(x, wts))
 }

Тестирование:

> Ddend.L <- label.leaves(Ddend)
> rapply(Ddend.L, function(x) return( attr(x, "ID") ))
[1] 1 2 3 4 5 6