STAR aligner не меняет результат "TranscriptomeSAM"
Когда я изменяю параметры выравнивания из параметров STAR по умолчанию, изменяется выходной файл bam, но не "TranscriptomeSAM".bam.
Чтобы быть конкретным, когда я добавил
" --outFilterScoreMinOverLread 0 \
--outFilterMatchNminOverLread 0 \
--outFilterMatchNmin 20 \
--outFilterMismatchNoverLmax 0.05 "
"TranscriptomeSAM".bam не меняется. Выравнивание по геному значительно отличается от параметров по умолчанию.
Может кто-нибудь объяснить, почему это произошло?