Запуск сценария Fiji Jython из командной строки
Я использую Фиджи для целей медицинской визуализации. Я написал сценарий jython и хотел бы запустить его из командной строки в Windows 7. Я пробовал разные способы запуска сценария, но не смог этого сделать. Кто-то, пожалуйста, помогите в достижении желаемая цель.
2 ответа
Существует два способа запуска сценариев с Фиджи.
Плохой путь
Откройте консоль и измените рабочий каталог на папку Фиджи. Эта папка должна содержать двоичный файл ImageJ (например, ImageJ-win64.exe), файлы jar, плагины и т. Д.
cd c:\Fiji.app
Запустите ImageJ. ImageJ-win64.exe - просто двоичное имя в моем дистрибутиве. Это может варьироваться.
ImageJ-win64.exe --headless --jython my_script.py
Вы также можете прочитать помощь Фиджи там, просто запустите ImageJ-win64.exe --help
Надлежащим образом
Добавьте папку Fiji (c:\Fiji.app) в переменную PATH и запускайте сценарии из любого каталога.
См. Запуск сценариев в автономном режиме на вики-странице Фиджи.
Если у вас все еще есть проблемы, пожалуйста, предоставьте больше информации о том, что вы пробовали и что пошло не так; см. Как мне задать хороший вопрос? для деталей.