Snakemake не распознает файлы со ссылками в качестве входных файлов

Я запускаю конвейер snakemake для пары файлов, которые я создал по символической ссылке из другого каталога.

Тем не менее, кажется, что файл snakemake не распознает входные файлы, когда они имеют символические ссылки. Это должно произойти, или есть что-то вокруг этого? Я получаю сообщение об ошибке "отсутствуют входные файлы".

Когда я помещаю свой входной файл в тот же каталог и запускаю скрипт, он работает нормально. Нет ничего страшного в том, чтобы разбираться с вещами, но с кучей данных это может быть немного больше проблем, чем оно того стоит.

Версия 4.6.0

0 ответов

Другие вопросы по тегам