KEGG Аннотация
У меня есть набор генов (аминокислотных последовательностей). Я хочу найти функциональные аннотации на основе Kegg или идентификаторы KO. Есть ли какая-либо база данных KEGG для скачивания? Я хочу использовать Blast с этой базой данных. Кроме того, я искал пакет R, который может помочь мне в этом отношении.
Надеюсь, я уточнил свой запрос. Спасибо за ваш ответ заранее.
1 ответ
Решение
База данных KEGG требует подписки:
https://www.bioinformatics.jp/en/keggftp.html
Прайс-лист:
https://www.bioinformatics.jp/docs/subscription_schedule.pdf
Если вы по-прежнему заинтересованы, вот список доступных данных:
https://www.kegg.jp/kegg/download/
ФАСТА последовательности здесь: