Установка пакета Bioconductor: отсутствует репозиторий

Question

Я пытаюсь опубликовать блестящее приложение, но получаю следующую ошибку. Мой код отлично работает в Rstudio. Только получить эту ошибку, когда я пытаюсь опубликовать его.

             install.packages("BiocManager")

 
     BiocManager::install("Rgraphviz")

Ошибка: необработанное исключение: сбой дочерней задачи 1195199124: ошибка синтаксического анализа манифеста: невозможно определить источник пакета для пакета Bioconductor BiocGenerics: необходимо указать репозиторий Выполнение остановлено

Как я могу решить эту проблему? Как указать репозиторий? ТИА

Answer 1

Перед публикацией приложения запуститеoptions(repos = BiocManager::repositories())на вашей консоли. НЕ копируйте этот код в скрипты вашего приложения. Затем опубликуйте свое приложение. Нет необходимостиinstall.packages("BiocManager")илиBiocManager::install("Rgraphviz")