Импорт матриц подстановки переменных на основе строкового ввода Python
Я пытаюсь импортировать матрицу замещения для реализации алгоритма Нидлмана-Вунша в Python на основе заданного ввода. Если я хочу выбрать одну матрицу, я могу сделать это так:
from Bio.SubsMat import MatrixInfo as matlist
scoring_mat = matlist.blosum62
Что я должен был бы сделать, если бы я хотел импортировать любую матрицу на основе входных данных? У меня есть это на данный момент:
def blosum(name):
index = str(name)
x= "blosum"+index
return x
a= blosum(62)
scoring_mat = matlist.a
К сожалению, это дает мне следующую ошибку:
AttributeError: module 'Bio.SubsMat.MatrixInfo' has no attribute 'a'
Что мне нужно сделать, чтобы это сработало?
Заранее спасибо!
1 ответ
Пытаться scoring_mat = getattr(matlist,a)
вместо. Это сработало для меня.