Как добавить синтаксис передачи uid к метамету набора данных

Question

Я использую библиотеку pydicom для генерации файлов.dcm с использованием наборов данных, поступающих с компьютеров КТ и МРТ, однако в этом наборе данных тег (0002,0010) отсутствует. Поскольку у меня нет этого тега, я не могу определить синтаксис передачи, является ли он неявным VR с прямым порядком байтов, явным VR с прямым порядком байтов, jpeg без потерь и т. Д. Мне нужен синтаксис передачи для сохранения набора данных с флагами, как показано ниже

    ds.is_little_endian = True
    ds.is_implicit_VR = False
    ds.file_meta.TransferSyntaxUID = JPEGLossless
    ds.is_explicit_VR = True  etc

Если я не использую вышеупомянутые флаги, то генерируемый файл dcm не будет действительным, так как нет синтаксиса передачи. Так как я не знаю синтаксис передачи, я отправляю синтаксис передачи в аргументах командной строки при запуске программы, соответственно устанавливаю вышеуказанные флаги и сохраняю набор данных. Я знаю, что это неправильный метод, но я просто использовал его как временное решение. Есть ли лучший способ определить синтаксис передачи, пожалуйста, так как тег (0002, 0010) отсутствует. Ниже приведен мой код, который я использую для сохранения файла dcm с использованием набора данных, поступающего с компьютера CT. Сейчас я посылаю синтаксис передачи в качестве аргумента командной строки

from pynetdicom3 import AE, VerificationPresentationContexts,      StoragePresentationContexts, QueryRetrievePresentationContexts
from pydicom.uid import ImplicitVRLittleEndian, ExplicitVRLittleEndian, JPEGLossless
from pynetdicom3.sop_class import CTImageStorage, MRImageStorage
from pynetdicom3 import pynetdicom_uid_prefix
from pydicom.dataset import Dataset, FileDataset


import argparse

import uuid
import os
import django
import logging

ttt = []
ttt.extend(VerificationPresentationContexts)
ttt.extend(StoragePresentationContexts)
ttt.extend(QueryRetrievePresentationContexts)


os.environ.setdefault('DJANGO_SETTINGS_MODULE', 'lh_dcm_viewer.settings')
django.setup()



from dcm_app.models import DCMFile, DCMFileException

def _setup_argparser():


parser = argparse.ArgumentParser(
    description="The getscp application implements a Service Class "
                "Provider (SCP) for the Query/Retrieve (QR) Service Class "
                "and the Basic Worklist Management (BWM) Service Class. "
                "getscp only supports query functionality using the C-GET "
                "message. It receives query keys from an SCU and sends a "
                "response. The application can be used to test SCUs of the "
                "QR and BWM Service Classes.",
    usage="getscp [options] port")

# Parameters

# Transfer Syntaxes
ts_opts = parser.add_argument_group('Preferred Transfer Syntaxes')
ts_opts.add_argument("--type",
                     help="prefer explicit VR local byte order (default)")
ts_opts.add_argument("--detect_transfer_syntax",
                     help="Detect transfer syntax")
ts_opts.add_argument("--port",
                     help="port at which the SCP listens")



return parser.parse_args()


args = _setup_argparser()


ae = AE(ae_title=b'MY_ECHO_SCP', port=int(args.port))

   if args.type == "jpeg_lossless":
ae.add_supported_context('1.2.840.10008.1.2.4.57')
   elif args.type == "implicit":
ae.add_supported_context('1.2.840.10008.1.2')
print("ImplicitVRLittleEndian")
   elif args.type == "explicit":
ae.add_supported_context('1.2.840.10008.1.2.1')


ae.requested_contexts = ttt
ae.supported_contexts = ttt
DICOM_IP = '192.168.1.11'
DICOM_IP = '127.0.0.1'
DICOM_PORT = 5678



def save_file(dataset, context, info):


try:

    random_str = uuid.uuid4().hex
    meta = Dataset()
    meta.MediaStorageSOPClassUID = dataset.SOPClassUID
    meta.MediaStorageSOPInstanceUID = dataset.SOPInstanceUID
    meta.ImplementationClassUID = pynetdicom_uid_prefix
    meta.FileMetaInformationGroupLength = 202


    received_file_path = "../received_dcms/%s.dcm" % random_str

    dataset_vr = None
    try:
        dataset_vr = dataset[("6000", "3000")].VR
    except KeyError:
        pass

    print(dataset_vr)

    if args.type == "implicit" or dataset_vr == "OB or OW":


        ds = FileDataset(received_file_path, {}, file_meta=meta, preamble=b"\0" * 128)
        ds.update(dataset)
        ds.is_little_endian = True
        ds.is_implicit_VR = True

        if(dataset_vr == "OB or OW"):
            print("forced ImplicitVRLittleEndian")

        ds.file_meta.TransferSyntaxUID = ImplicitVRLittleEndian
    elif args.type == "jpeg_lossless":
        ds = FileDataset(received_file_path, {}, file_meta=meta, preamble=b"\0" * 128)
        ds.update(dataset)
        ds.is_little_endian = True
        ds.is_implicit_VR = False
        ds.file_meta.TransferSyntaxUID = JPEGLossless
        ds.is_explicit_VR = True
    elif args.type == "explicit":
        meta.TransferSyntaxUID = "1.2.840.10008.1.2.1"

        ds = FileDataset(received_file_path, {}, file_meta=meta, preamble=b"\0" * 128)
        ds.update(dataset)
        ds.is_little_endian = True

        ds.is_implicit_VR = False
        ds.file_meta.TransferSyntaxUID = ExplicitVRLittleEndian
        ds.is_explicit_VR = True

    ds.save_as(received_file_path)

    f = open(received_file_path, "rb")

    f.close()

    return 0XC200
    return status
except Exception as e:

    logger.error(e)



ae.on_c_store = save_file
ae.start()

Answer 1

Ненавижу вас отсылать, но это очень специализированный инструмент, и у него есть собственное сообщество поддержки. Я посмотрел вашу проблему и обнаружил, что это может быть ошибка. Есть пользователь, у которого есть подобная проблема, и он сказал, что синтаксис передачи не пропущен, если он использует более старую версию библиотеки.

ПОХОЖИЕ ВОПРОСЫ: https://groups.google.com/forum/

Поддержка этой библиотеки находится здесь: https://groups.google.com/forum/

Сам код поддерживается на GitHub, где вы можете открывать отчеты об ошибках и просматривать все другие отчеты об ошибках: https://github.com/pydicom/pydicom/issues