Вопрос о сопоставлении FHIR и OMOP: систолическое и диастолическое артериальное давление с несопоставленным, недействительным кодом (55284-4)

Question

Существует концепция LOINC 55284-4, которая появляется в некоторых ресурсах FHIR, например:https://syntheticmass.mitre.org/v1/fhir/Patient/0000aa42-c235-4447-8389-8a2640f44466/$everything

Этот код предназначен для «систолического и диастолического артериального давления» и находится в таблице понятий OMOP, как показано ниже.

Эта концепция не является стандартной концепцией, недопустимой концепцией (с точки зрения OMOP) и не имеет сопоставления ни с одной стандартной концепцией в OMOP.

Эта концепция появляется в ресурсе FHIR во фрагменте, показанном ниже (из приведенного выше URL-адреса synthmass).

Какие записи должны быть созданы в OMOP для представления показанного ниже фрагмента?

              "resource": {
            "category": [
                {
                    "coding": [
                        {
                            "code": "vital-signs",
                            "display": "vital-signs",
                            "system": http://hl7.org/fhir/observation-category
                        }
                    ]
                }
            ],
            "code": {
                "coding": [
                    {
                        "code": "55284-4",
                        "display": "Blood Pressure",
                        "system": http://loinc.org
                    }
                ],
                "text": "Blood Pressure"
            },
            "component": [
                {
                    "code": {
                        "coding": [
                            {
                                "code": "8462-4",
                                "display": "Diastolic Blood Pressure",
                                "system": http://loinc.org
                            }
                        ],
                        "text": "Diastolic Blood Pressure"
                    },
                    "valueQuantity": {
                        "code": "mmHg",
                        "system": http://unitsofmeasure.org,
                        "unit": "mmHg",
                        "value": 84.88290301982099
                    }
                },
                {
                    "code": {
                        "coding": [
                            {
                                "code": "8480-6",
                                "display": "Systolic Blood Pressure",
                                "system": http://loinc.org
                            }
                        ],
                        "text": "Systolic Blood Pressure"
                    },
                    "valueQuantity": {
                        "code": "mmHg",
                        "system": http://unitsofmeasure.org,
                        "unit": "mmHg",
                        "value": 117.69213707496547
                    }
                }
            ],
            "context": {
                "reference": "Encounter/52430cb1-a0d3-4d1e-926c-c878c218502e"
            },
            "effectiveDateTime": "2018-05-06T04:07:24-04:00",
            "id": "186e8672-f9ac-4419-8c5d-1e824bf6e536",
            "issued": "2018-05-06T04:07:24.278-04:00",
            "meta": {
                "lastUpdated": "2019-04-09T08:36:08.363897+00:00",
                "versionId": "MTU1NDc5ODk2ODM2Mzg5NzAwMA"
            },
            "resourceType": "Observation",
            "status": "final",
            "subject": {
                "reference": "Patient/0000aa42-c235-4447-8389-8a2640f44466"
            }
        }

---

РЕДАКТИРОВАТЬ: ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ Похоже, что это, вероятно, часто используемые концепции артериального давления в OMOP.

      select 
    * 
from 
    concept 
where 1=1
    and (
        lower(concept_name) = 'systolic blood pressure' or
        lower(concept_name) = 'diastolic blood pressure')
    and domain_id = 'Measurement'
    and standard_concept = 'S';

И есть масса других потенциальных кандидатов (их около 380):

      select 
    * 
from 
    concept 
where 1=1
    and lower(concept_name) like '%blood pressure%'
    and domain_id = 'Measurement'
    and standard_concept = 'S';

Answer 1

Я бы сопоставил его так же, как если бы это был код LOINC 85354-9. Однако вам следует сообщить о проблеме в Synthea, поскольку использование кода 55284-4 без перевода 85354-9 не соответствует требованиям. (Все совместимые с FHIR системы, передающие комбинированное наблюдение «кровяного давления», должны придерживаться этого профиля, который предписывает код 85354-9.)