BLAST Command Line - перезапуск

Я недавно установил BLAST для командной строки в Windows (см. Код ниже), и это работает.

Тем не менее, когда я перезапускаю приглашение командной строки, команда blastn не работает сразу, если я не вернусь к фактической папке и не введу команду. То же самое относится к настройке локальной базы данных; Я должен повторно запустить код, который устанавливает базу данных. Поэтому мне было интересно, как загрузить функциональные возможности и объекты BLAST в командную строку немедленно, а не переделывать работу.

#Command line BLAST
#Download BLAST: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/
#Install: ncbi-blast-2.7.1+-win64.exe
#Save test.fasta in  C:\Program Files\NCBI\blast-2.7.1+
cd C:\Program Files\NCBI\blast-2.7.1+
blastn -version
blastn -db nr -query test.fasta -remote -out test_query.txt
Источник

0 ответов

Другие вопросы по тегам