Извлекайте данные о реакциях в виде графиков из Reactome
Я пытаюсь извлечь данные о реакциях из Reactome . Я хотел бы видеть каждую реакцию в виде графика, имеющего:
- список участвующих субъектов (входы и выходы) длиной N.
- Матрица смежности графа, как двоичный мартикс размером NxN, представляющая граф, представленный в Reactome для реакции.
можно ли это сделать с файлами SBGN или SBML с помощью Python? кто-нибудь может привести пример?
Благодарность