Сортировка файла Bam выполняется очень медленно
Я пытаюсь использовать функцию сортировки samtools для сортировки файла BAM (с именем PT2) (размер 180 мегабайт), который не велик. Сортировка никогда не заканчивается, и сообщение об ошибке не появляется. Я проверил память виртуальной машины Ubunto с помощью (файл meminfo в папке proc на домашней учетной записи). Также у меня есть около 80 гигабайт дискового пространства.
Первый код: samtools sort -o output / PT2_sorted.bam output / PT2.bam (очень медленно wwwww)
второй код: samtools sort -o output / PT2_sorted.bam output / PT2.bam (очень медленно)
Как вы думаете, в чем причина такой медленной работы? любой совет ?
Спасибо