из dgl.data.chem импортировать mol_to_bigraph, smiles_to_bigraph не работает

Я работаю над проблемой классификации графов на основе молекул. Мои данные - это SMILES, и я хочу преобразовать их в график и построить модель с помощью пакета DGL.

Я установил пакет dgl с помощью pip install dgl в spyder и ! pip install dgl в google colab. Я могу импортировать этот пакет с помощью import dgl, но когда я использую from dgl.data.chem import mol_to_bigraph, smiles_to_bigraph, он дает мне эту ошибку:

Нет модуля с именем dgl.data.chem

В чем проблема? Есть ли у кого-нибудь опыт исправления этой ошибки? Благодарю.

2 ответа

Решение

Я не уверен, существует ли набор данных для химии. Я установил пакет dgl, но его нет в каталоге dgl/data, который я вижу. Я также не вижу этого в dgl docs.

Они переместили их в филиал библиотеки DGL Life.

проверить этот документ.

https://lifesci.dgl.ai/api/utils.mols.html

Другие вопросы по тегам