как применить курсивный и нормальный шрифты к одной метке в филогенетическом дереве в ggtree
Я хочу, чтобы A было выделено курсивом, а CBS - обычным шрифтом. Я думаю, что ggtext может быть полезен, но у меня ошибка. вот пример:
tree<-read.tree(text="(A,(B,C));")
labs=c("*A*CBS","B","C")
tree$tip.label<-labs
ggtree(tree)+ geom_tiplab(align=T) + geom_richtext()
error: geom_rich_text requires the following missing aesthetics: label
Я тоже пробовал
ggtree(tree)+ aes(label=labs)+geom_tiplab(align=T) + geom_richtext()
error: Aesthetics must be either length 1 or the same as the data (5): label
но богатый текст, который мне нужен, находится в трех ярлыках наконечников, а не на всех пяти ярлыках (наконечник и узел). Кто-нибудь знает, как добавить эстетику ярлыка (как ярлык наконечника)?
1 ответ
Решение
Вы можете использовать
parse = T
аргумент в сочетании с математической аннотацией:
library(ggtree)
library(ggtext)
tree<-read.tree(text="(A,(B,C));")
labs=c("paste(italic('A'),'CBS')","B","C")
tree$tip.label<-labs
ggtree(tree)+ geom_tiplab(align=T,parse=T)