Проблемы с настройкой R, OpenMP и glmmTMB
Я смотрю на пару сложных моделей, которые, похоже, требуют больших вычислительных мощностей. В настоящее время я использую пакет R "glmmTMB" для учета пространственно-временной автокорреляции и случайных эффектов. Теоретически glmmTMB должна работать намного быстрее при использовании распараллеливания: https://cran.r-project.org/web/packages/glmmTMB/vignettes/parallel.html
Если ваша ОС поддерживает распараллеливание OpenMP и R был установлен с использованием OpenMP, glmmTMB автоматически подберет флаги OpenMP из Makevars R и скомпилирует модель C++ с поддержкой OpenMP. Если флаг недоступен, модель будет скомпилирована только с последовательной оптимизацией.
Вместо того, чтобы запускать эти модели на моем личном компьютере, я решил создать виртуальный станок в среде HPC. Как я могу установить R с помощью OpenMP в Ubuntu 20.04? Я не нашел ничего по этой теме.