Это нормально, что результат добавления метаданных biom с использованием v2.1.8 отличается от v2.1.7?
Я пытаюсь добавить образец метаданных в очень маленький файл BIOM (658 байтов, 2 образца) с помощью команды biom add-metadata (размер файла метаданных составляет 206 байтов). Однако я обнаружил, что использование biom версии 2.1.8 привело к гораздо большему размеру файла (36,17 КБ), чем при использовании biom версии 2.1.7 (615 байт). Кроме того, файл, созданный с помощью v2.1.8, не кажется простым текстовым файлом, так как было много неразборчивых символов, когда я пытался открыть его с помощью "more" на терминале или с помощью текстового редактора, тогда как файл, созданный с помощью v2.1.7, обычный текстовый файл.
На машине, которую я использовал, уже есть biom v2.1.7, но когда я попытался установить как v2.1.7, так и 2.1.8 с помощью conda, я увидел такое же поведение. Затем я попытался установить v2.1.8 с помощью pip (в среде conda), и все же разница, о которой я упоминал выше, есть.
Интересно, нормально это или ожидаемо.
Спасибо заранее за ваш вклад!
1 ответ
можно ли скопировать/вставить используемые команды? Записи журнала изменений для 2.1.7 — 2.1.8 можно найти здесь, хотя я не знаю об изменениях, которые изменили бы поведение вывода
add-metadata
. Возможно ли, что
h5py
пакет не был установлен в среде с 2.1.7?