Проблемы с использованием пакета velocyto.R

Я пытаюсь использовать "Скорость" для своих данных Single-cell RNA-Seq от 10X Genomics. Я прочитал всю информацию, которую я узнал, прежде чем Velocity должен подготовить файлы с помощью "DropEst".

Я использую свои данные, и теперь у меня есть три разных файла. 1) cell.count.rds 2) cell.count.mtx 3) cell.count.matrix.rds

Как я могу использовать эти файлы для запуска Velocity? Я проверил, есть ли возможность использовать с объектом Seurat. Но четких заявлений о том, как его использовать по моим данным, не нашел.

Я нашел эту ссылку:

http://pklab.med.harvard.edu/velocyto/notebooks/R/SCG71.nb.html

Но я этого не понимал.

0 ответов

Другие вопросы по тегам