Изменить порядок меток осей графика корреляционной матрицы

Я использую ggcorrplot для построения корреляционной матрицы, но вывод меняет порядок столбцов таким образом, который мне не нужен. Как изменить порядок столбцов?

Для целей этого примера я буду использовать набор данных mtcars, найденный в R. После создания окончательного вывода мне нужно переупорядочить столбцы, потому что он продолжает переупорядочиваться в формат, который мне не нужен.

Примечание. Код предоставляется на веб-сайте следующим образом: http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-quick-correlation-matrix-heatmap-r-software-and-data-visualization

library(ggcorrplot)

mydata <- mtcars

#correlation matrix
cormat <- round(cor(mydata),2)

library(reshape2)
melted_cormat <- melt(cormat)
head(melted_cormat)

library(ggplot2)
ggplot(data = melted_cormat, aes(x=Var1, y=Var2, fill=value)) + 
  geom_tile()

# Get upper triangle of the correlation matrix
get_upper_tri <- function(cormat){
  cormat[lower.tri(cormat)]<- NA
  return(cormat)
}

upper_tri <- get_upper_tri(cormat)

# Melt the correlation matrix
library(reshape2)
melted_cormat <- melt(upper_tri, na.rm = TRUE)
# Heatmap
library(ggplot2)
ggplot(data = melted_cormat, aes(Var2, Var1, fill = value))+
  geom_tile(color = "white")+
  scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white", 
                       midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab", 
                       name="Pearson\nCorrelation") +
  theme_minimal()+ 
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, 
                                   size = 12, hjust = 1))+
  coord_fixed()

Это корреляционная матрица, которую я хочу, но мне нужно переупорядочить столбцы в порядке, отличном от показанного.

Любая помощь была бы замечательной. Всем спасибо!

1 ответ

Решение

Предположим, мы хотим x-axis для заказа по названию (labels) по алфавиту и y-axisто же, но в обратном порядке. Следующий код работает (остальной код будет таким же).

ggplot(data = melted_cormat, aes(reorder(Var2,  -desc(as.character(Var2))), 
                                 reorder(Var1,  desc(as.character(Var1))), fill = value))+
  geom_tile(color = "white")+
  scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white", 
                       midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab", 
                       name="Pearson\nCorrelation") +
  theme_minimal()+ 
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1, 
                                   size = 12, hjust = 1))+
  coord_fixed()

Другие вопросы по тегам