Изменить порядок меток осей графика корреляционной матрицы
Я использую ggcorrplot для построения корреляционной матрицы, но вывод меняет порядок столбцов таким образом, который мне не нужен. Как изменить порядок столбцов?
Для целей этого примера я буду использовать набор данных mtcars, найденный в R. После создания окончательного вывода мне нужно переупорядочить столбцы, потому что он продолжает переупорядочиваться в формат, который мне не нужен.
Примечание. Код предоставляется на веб-сайте следующим образом: http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-quick-correlation-matrix-heatmap-r-software-and-data-visualization
library(ggcorrplot)
mydata <- mtcars
#correlation matrix
cormat <- round(cor(mydata),2)
library(reshape2)
melted_cormat <- melt(cormat)
head(melted_cormat)
library(ggplot2)
ggplot(data = melted_cormat, aes(x=Var1, y=Var2, fill=value)) +
geom_tile()
# Get upper triangle of the correlation matrix
get_upper_tri <- function(cormat){
cormat[lower.tri(cormat)]<- NA
return(cormat)
}
upper_tri <- get_upper_tri(cormat)
# Melt the correlation matrix
library(reshape2)
melted_cormat <- melt(upper_tri, na.rm = TRUE)
# Heatmap
library(ggplot2)
ggplot(data = melted_cormat, aes(Var2, Var1, fill = value))+
geom_tile(color = "white")+
scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white",
midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab",
name="Pearson\nCorrelation") +
theme_minimal()+
theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1,
size = 12, hjust = 1))+
coord_fixed()
Это корреляционная матрица, которую я хочу, но мне нужно переупорядочить столбцы в порядке, отличном от показанного.
Любая помощь была бы замечательной. Всем спасибо!
1 ответ
Предположим, мы хотим x-axis
для заказа по названию (labels
) по алфавиту и y-axis
то же, но в обратном порядке. Следующий код работает (остальной код будет таким же).
ggplot(data = melted_cormat, aes(reorder(Var2, -desc(as.character(Var2))),
reorder(Var1, desc(as.character(Var1))), fill = value))+
geom_tile(color = "white")+
scale_fill_gradient2(low = "blue", high = "red", mid = "white",
midpoint = 0, limit = c(-1,1), space = "Lab",
name="Pearson\nCorrelation") +
theme_minimal()+
theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, vjust = 1,
size = 12, hjust = 1))+
coord_fixed()