Проблемы с Hail0.2 при работе с Azure DataBrick
Здравствуйте? Кто-нибудь может помочь для Hail 0.2 в Azure DataBrick?
После установки pip возникло много проблем....
не могу найти пакет Java, импортировать hail.plot, hl.init()
Согласно документу
https://docs.azuredatabricks.net/applications/genomics/tertiary/hail.html
Я установил град
установите ENABLE_HAIL=true в настройках среды кластера
Однако
import hail as hl
hl.init(sc, idempotent=True)
AttributeError: module 'hail' has no attribute 'init'
Также еще один документ
https://docs.azuredatabricks.net/applications/genomics/tertiary/hail.html
import hail as hl
import hail.expr.aggregators as agg
hl.init(sc, idempotent=True)
ModuleNotFoundError: No module named 'hail.expr'
Кто-нибудь может дать решение? Большое спасибо!!!
2 ответа
Вы используете среду выполнения геномики? См. https://docs.microsoft.com/en-us/azure/databricks/runtime/genomicsruntime, чтобы запустить кластер со средой выполнения геномики. Тогда Hail будет установлен, если вы установитеENABLE_HAIL=true
переменная окружения.
Вы можете перейти на Azure HDInsight и следовать инструкциям на следующей странице в разделе Microsoft Azure:
https://hail.is/docs/0.2/cloud/other_cloud_providers.html
Это должно помочь вам начать работу!