keras plot_model говорит мне установить pydot

Question

Я использую Python 3.6.3 на машине с Windows 10. Я установил pydot и graphviz с помощью pip install через:

    py -m pip install pydot
    py -m pip install graphviz

Я также зашел на сайт graphviz и скачал и установил версию для Windows здесь: http://www.graphviz.org/Download_windows.php которая по умолчанию установлена ​​для программных файлов (x86). Но когда я собираюсь построить свою модель в керасе, я все равно получаю сообщение об ошибке, в котором говорится, что мне нужно установить pydot и graphviz, и что импорт не удался. я могу сделать

    import pydot
    import graphviz

на моей консоли python просто отлично, они не выдают ошибок. Что еще я должен сделать, чтобы иметь возможность отобразить мою нейронную сеть?

Answer 1

Путь к установленным исполняемым файлам GraphViz (dot, neato и т. д.) должны быть в PATH переменная среды, для того, чтобы pydot найти их. pydot используется для поиска этих исполняемых файлов в более ранних версиях, но не больше.

Также:

1. pydot это пакет Python
2. GraphViz - это набор инструментов, написанных на C для вычисления макетов графов
3. graphviz это пакет Python, совершенно не связанный с pydot, Эти два пакета Python никак не взаимодействуют друг с другом. Достаточно установить один из них (вместе с GraphViz).

Смотрите также:

• https://github.com/erocarrera/pydot/issues/126
• https://github.com/erocarrera/pydot/commit/812e3c40dac1e0225391481073c64da5bafba93e
• https://github.com/erocarrera/pydot/commit/812e3c40dac1e0225391481073c64da5bafba93e

и ссылки оттуда.

Answer 2

Просто для завершения решения @dataLeo пользователи Python 3 могут использовать пакет pydotplus вместо пакета pydot-ng. Подвести итоги:

1. Установите pydot+graphviz и pydotplus с помощью команд "conda install pydot" и "conda install -c conda-forge pydotplus".
2. Перейдите в файл vis_utils.py и измените строку 11 из import pydot в import pydotplus as pydot,

PS: Вы можете найти файл vis_utils.py, проверив справку по команде plot_model в консоли ipython, т.е. после from keras.utils import plot_model, тип ??plot_model в консоли ipython.

Протестировано на Windows 10-64 бит с Anaconda python-3.6

Answer 3

В дополнение к ответу @Ioannis вам необходимо установить исполняемые файлы GraphViz через conda (conda install GraphViz).

В моем случае после установки GraphViz я попробовал использовать последнюю версию pydot (pip install pydot) и ошибка была устранена.

Answer 4

Я решил эту проблему, установив пакеты с:

      conda install graphviz
conda install pydot
conda install pydotplus