Ошибка Nextflow в 1 процессе останавливает все остальные процессы

Question

Когда я отправляю задание в следующем потоке, происходит сбой одного из процессов, поврежденный файл. Очевидно, что я могу удалить этот файл из списка заданий, но я не хочу, чтобы это произошло в будущем, когда я увеличу его масштаб. По умолчанию это останавливает выполнение всех других процессов (9), и задание следующего потока завершается.

Как я могу помешать этой неудачной работе повлиять на других?

Answer 1

Я нашел ответ после еще нескольких копаний в документации здесь ( https://www.nextflow.io/docs/latest/process.html). Мне нужно было добавить errorStrategy 'finish' в мой процесс

process ignoreAnyError {
    errorStrategy 'finish'
    script:
    <your command string here>
}