Использование информации атрибутов DICOM для определения диапазона значений пикселей кости

Question

Я работаю с DICOM CT изображениями, чтобы сегментировать кости. Мне было интересно, могу ли я использовать информацию атрибутов DICOM для определения диапазона значений пикселей кости.

Answer 1

Глава 3, Приложение A.3 стандарта DICOM [1] определяет IOD для набора данных CT. Он состоит, среди прочего, из модуля пиксельных изображений (C.7.6.3). Модуль пикселей имеет два атрибута: "Наименьшее значение пикселя изображения" (0028,0106) и "Наибольшее значение пикселя изображения" (0028,0107). Однако это атрибуты типа 3, которые могут отсутствовать в вашем наборе данных.

[1] http://medical.nema.org/medical/dicom/current/output/pdf/part03.pdf

Answer 2

Вы никогда не должны полагаться на атрибуты типа 3. В вашем конкретном случае (CT) это так же тривиально, как чтение Rescale Slope и Rescale Intercept. Эти атрибуты позволяют преобразовывать значения пикселей в HU или другие единицы, как указано в атрибуте Rescale Type.

Для изображений CT, единица должна быть HU (Hounsfield). Поэтому после преобразования вы можете найти общеизвестные значения для костей:

http://en.wikipedia.org/wiki/Hounsfield_scale