Ошибка rMATS "невозможно получить доступ к общей библиотеке"

Question

Я пытаюсь запустить rMATS на кластере Linux (CentOS). На этой системе у меня нет root-доступа. Я установил несколько пакетов зависимостей rMATS с помощью anaconda conda install менеджер пакетов.

rMATS не может получить доступ к общей библиотеке libblas.so.3 в системе и выдает ошибку rMATSexe: error while loading shared libraries: libblas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

Хотя я нашел libblas.so.3 библиотека в моей системе /Users/paul/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3 Я не уверен, как сделать его доступным для программного обеспечения rMATS в качестве "общей библиотеки".

я пытался export LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib/libblas.so.3 но это не сработало.

Где я могу поместить эту библиотеку libblas.so.3, чтобы она могла быть найдена системой?

Answer 1

LD_LIBRARY_PATH путь к каталогу, а не путь к файлу Вы хотите установить это так:

LD_LIBRARY_PATH=/Users/ranum/anaconda3/pkgs/lapack-3.6.1-1/lib