Создание модели Python lmfit с произвольным количеством параметров

Есть ли способ построить модель lmfit на основе функции с произвольным числом зависимых переменных? Например:

from lmfit import Model

def my_poly(x, *params):
  func = 0
  for i in range(len(params)):
    func+= params[i]*z**i
  return func

#note: below does not work
my_model = Model(my_poly, independent_vars = ['x'], param_names = ['A','B','C'])

Что-то похожее на вышесказанное было бы замечательно, если бы я заинтересовался полиномиальными сериями и хотел бы проверить производительность по мере роста или уменьшения серии.

1 ответ

Решение

Поскольку Model() использует имена аргументов функций для построения имен параметров, используя *params не будет легко работать (как узнать, как их назвать A, B, C, и не coeff0, coeff1, coeff2, или что-то другое?).

Я не знаю, что действительно произвольное число может быть поддержано, но должно быть возможно сделать очень большое число. Полиномиальная модель (см. http://lmfit.github.io/lmfit-py/builtin_models.html и https://github.com/lmfit/lmfit-py/blob/master/lmfit/models.py для реализации) поддерживает до 7 коэффициентов. Не должно быть никаких проблем распространить это на гораздо большее число. Это может легко привести к вычислительным проблемам, но я думаю, это то, что вы ожидаете изучить.

Если вы хотите внести небольшое изменение, можно сделать что-то, что вы ищете. Это использует аргументы ключевого слова вместо позиционных аргументов и опирается на порядок имен параметров (то есть с sort), чтобы указать, какой коэффициент идет с каким показателем, а не порядком позиционных аргументов. Это может быть близко к тому, что вы ищете:

import numpy as np

from lmfit import Model, Parameters

def my_poly(x, **params):
    val= 0.0
    parnames = sorted(params.keys())
    for i, pname in enumerate(parnames):
        val += params[pname]*x**i
    return val

my_model = Model(my_poly)

# Parameter names and starting values
params = Parameters()
params.add('C00', value=-10)
params.add('C01', value=  5)
params.add('C02', value=  1)
params.add('C03', value=  0)
params.add('C04', value=  0)

x = np.linspace(-20, 20, 101)
y = -30.4 + 7.8*x - 0.5*x*x + 0.03 * x**3 + 0.009*x**4
y = y + np.random.normal(size=len(y), scale=0.2)

out = my_model.fit(y, params, x=x)
print(out.fit_report())

Надеюсь, это поможет.

Другие вопросы по тегам