Заполнить список кортежами
Я просто возлюсь с симуляцией ( Первый закон наследования Менделя).
Прежде чем я смогу дать возможность матерям спариться и проанализировать результат, необходимо сформировать популяцию, т. Е. Список должен быть заполнен различными числами трех разных типов кортежей, не распаковывая их.
Пытаясь ознакомиться с itertools (позже мне понадобятся комбинации в сопряженной части), я нашел следующее решение:
import itertools
k = 2
m = 3
n = 4
hd = ('A', 'A') # homozygous dominant
het = ('A', 'a') # heterozygous
hr = ('a', 'a') # homozygous recessive
fhd = itertools.repeat(hd, k)
fhet = itertools.repeat(het, m)
fhr = itertools.repeat(hr, n)
population = [x for x in fhd] + [x for x in fhet] + [x for x in fhr]
что приведет к:
[('A', 'A'), ('A', 'A'), ('A', 'a'), ('A', 'a'), ('A', 'a'), ('A', 'a'), ('A', 'a'), ('A', 'a'), ('A', 'a')]
Есть ли более разумный, питонный или экономящий память способ составления окончательного списка, например, без создания сначала списков для трех типов лиц?
3 ответа
Вы могли бы использовать itertools.chain
объединить итераторы:
population = list(itertools.chain(fhd, fhet, fhr))
Хотя я бы сказал, что нет необходимости использовать itertools.repeat
когда вы могли бы просто сделать [hd] * k
, Действительно, я бы подошел к этой симуляции следующим образом:
pops = (20, 30, 44)
alleles = (('A', 'A'), ('A', 'a'), ('a', 'a'))
population = [a for n, a in zip(pops, alleles) for _ in range(n)]
или возможно
allele_freqs = ((20, ('A', 'A')),
(30, ('A', 'a')),
(44, ('a', 'a')))
population = [a for n, a in allele_freqs for _ in range(n)]
Это должно работать, я полагаю.
pops = [2,3,4]
alleles = [('A','A'), ('A', 'a'), ('a','a')]
out = [pop*[allele] for pop, allele in zip(pops,alleles)]
print [item for sublist in out for item in sublist]
Я поместил код на CodeBunk, чтобы вы могли запустить его тоже.
population = 2*[('A', 'A')] + 3*[('A', 'a')] + 4*[('a', 'a')]
или же
hd = ('A', 'A') # homozygous dominant
het = ('A', 'a') # heterozygous
hr = ('a', 'a') # homozygous recessive
population = 2*[hd] + 3*[het] + 4*[hr]