Код TMB C++ в пакете R и проверки CRAN

Я работаю над пакетом R для включения шаблонов C++, созданных в TMB. Используя полезные рекомендации, изложенные в этом предложении, мне удалось пройти очень долгий путь.

На данный момент я использую 2 шаблона C++ ("kglmer.cpp" и "nglmer.cpp") и следующий Makefile.win (и эквивалентный Makefile) для создания DLL:

all: kglmer.dll nglmer.dll

kglmer.dll: kglmer.cpp
    Rscript --vanilla -e "TMB::compile('kglmer.cpp', '-O1 -g',DLLFLAGS='')"
nglmer.dll: nglmer.cpp
    Rscript --vanilla -e "TMB::compile('nglmer.cpp', '-O1 -g',DLLFLAGS='')"

clean:
    rm -rf *o

Однако при запуске проверок CRAN (используя devtools::check()), Я получаю следующее предупреждение:

checking if this is a source package ...
     Subdirectory '/src' contains apparent object files/libraries
     kglmer.dll nglmer.dll
Object files/libraries should not be included in a source package.

Кажется, проблема связана с неправильной очисткой папки src. Есть ли у вас какие-либо предложения о том, как поступить?

Источник

1 ответ

Решение

clean цели должны соответствовать all цель, то есть в Makefile.win у тебя должно быть

clean:
    rm -rf *.dll
Источник
Другие вопросы по тегам