Извлечение 3D-координат из файлов STL (в лучшем случае) или файлов DICOM (в худшем случае) в R
Я нашел пакеты для импорта STL (функция readSTL, пакет rgl) и файлов DICOM (функция readDICOMFile, пакет oro.dicom) в R.
Одна из причин, по которой я импортирую медицинские изображения в R, заключается в том, что я хочу извлечь из изображений несколько функций:
- площадь поверхности анатомического участка
- координаты x,y,z для каждого из ~200 анатомических сайтов на изображение
При работе с 2D-изображением я смог выбрать координаты x, y с помощью WebPlotDigitizer.
Я знаю, как визуально сопоставить мои сайты с областями медицинского изображения, первоначально с помощью компьютерной томографии. Как только он окажется в R, как я могу извлечь географические координаты и информацию о площади поверхности из трехмерного изображения?
Позже я хотел бы проецировать различные функции моего анализа на координаты, так что это необходимый шаг в процессе обработки данных.
Сможете ли вы указать мне учебники R, виньетки, учебники или другие источники информации, которые могут помочь мне на моем пути?