Как я могу расширить дерево в ggtree?
Есть ли способ, как растянуть филогенетическое дерево в ggtree вдоль оси Y. Я имею в виду сделать то же самое, что и расширение в Figtree. Без этого каждая терминальная ветвь слишком близка к другой, если есть много подсказок.
1 ответ
Вы не можете развернуть ось Y в интерактивном режиме, как в Figtree.
В R развернуть ось Y (или ось X, если хотите) можно, сохранив свою фигуру в файл с большей высотой (или шириной для оси X).
Если у вас есть дополнительные вопросы, пожалуйста, напишите в https://groups.google.com/d/forum/bioc-ggtree
ссылка
Г Ю, ДК Смит, Х Чжу, Й Гуан, TTY Лам *. ggtree: пакет R для визуализации и аннотирования филогенетических деревьев с их ковариатами и другими соответствующими данными. Методы в экологии и эволюции. doi:10.1111/2041-210X.12628,