RcppParallel RVector push_back или что-то подобное?

Question

Я использую RcppParallel, чтобы ускорить некоторые вычисления. Тем не менее, у меня не хватает памяти в процессе, поэтому я хотел бы сохранить результаты в параллельном цикле, которые превышают порог релевантности. Ниже приведен пример с игрушкой, иллюстрирующий мою точку зрения:

#include <Rcpp.h>
#include <RcppParallel.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::depends(RcppParallel)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
struct Example : public RcppParallel::Worker {
  RcppParallel::RVector<double> xvals, xvals_output, yvals;
  Example(const NumericVector & xvals, NumericVector & yvals, NumericVector & xvals_output) : 
    xvals(xvals), xvals_output(xvals_output), yvals(yvals) {}
  void operator()(std::size_t begin, size_t end) {
    for(std::size_t i=begin; i < end; i++) {
      double y = xvals[i] * (xvals[i] - 1);
      // if(y < 0) {
      //   xvals_output.push_back(xvals[i]);
      //   yvals.push_back(y);
      // }
      xvals_output[i] = xvals[i];
      yvals[i] = y;
    }
  }
};
// [[Rcpp::export]]
List find_values(NumericVector xvals) {
  NumericVector xvals_output(xvals.size());
  NumericVector yvals(xvals.size());
  Example ex(xvals, yvals, xvals_output);
  parallelFor(0, xvals.size(), ex);
  List L = List::create(xvals_output, yvals);
  return(L);
}

Код R будет:

find_values(seq(-10,10, by=0.5))

Закомментированный код - это то, что я хотел бы сделать.

То есть я хотел бы инициализировать пустой вектор и добавить только значения y, которые превышают определенный порог, а также соответствующие значения x.

В моем реальном использовании я вычисляю матрицу MxN, поэтому проблема с памятью.

Как правильно подойти к этому вопросу?

Answer 1

Если кто-нибудь когда-либо сталкивался с подобной проблемой, вот решение, использующее "concurrent_vector" из TBB (который RcppParallel использует под капотом и доступен в качестве заголовка).

#include <Rcpp.h>
#include <RcppParallel.h>
#include <tbb/concurrent_vector.h>
using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::depends(RcppParallel)]]
// [[Rcpp::plugins(cpp11)]]
struct Example : public RcppParallel::Worker {
  RcppParallel::RVector<double> xvals;
  tbb::concurrent_vector< std::pair<double, double> > &output;
  Example(const NumericVector & xvals, tbb::concurrent_vector< std::pair<double, double> > &output) : 
    xvals(xvals), output(output) {}
  void operator()(std::size_t begin, size_t end) {
    for(std::size_t i=begin; i < end; i++) {
      double y = xvals[i] * (xvals[i] - 1);
      if(y < 0) {
        output.push_back( std::pair<double, double>(xvals[i], y) );
      }
    }
  }
};
// [[Rcpp::export]]
List find_values(NumericVector xvals) {
  tbb::concurrent_vector< std::pair<double, double> > output;
  Example ex(xvals,output);
  parallelFor(0, xvals.size(), ex);
  NumericVector xout(output.size());
  NumericVector yout(output.size());
  for(int i=0; i<output.size(); i++) {
    xout[i] = output[i].first;
    yout[i] = output[i].second;
  }
  List L = List::create(xout, yout);
  return(L);
}

Выход:

> find_values(seq(-10,10, by=0.5))
[[1]]
[1] 0.5

[[2]]
[1] -0.25