Шаги для чтения текстового файла в определенные столбцы JTable с использованием biojava

Вот типичный ввод .txt файл (также называемый как файл fasta):

> Длина contig00001 =586   numreads=4
CGGGAAATTATCcGCGCCTTCACCGCCGCCGGTTCCACCGACGAACGGATACTGCGtGaa
ggCCGCGATCCCGTCggaCGGAAAaCGCCcTGGCCCGGGAaCATACCGTTCGGGCCGCCA
AGTGTTATAGCCGGACCACTTGTCAGAACATTTCCaaTCCGAAGATGTGAGTtCGGAAGg
TAAAAGCCCGACAAGTTGCGCGgTGAATTTACCTTtACcGCACGATATGCGTCCGTATTA
AaGAAAaGTTCGAAATTATCAGTAAGGCCGACCTGAAaGCTGACCGGGAGTTCAACAAAA
TCTGCATCACCcGGgTCACGGTCGAAATTGCTGTACGCGGCGCTGAACGTAAATTCACCC
TTTcTAAGGGTGTCGCcGTCGTAAACCGTAAaCAaGCCGGTAGCGCCGCCCATCGGGCCG
CCGGTACCAACCGTCGGTGCCGTGTTTCTtGCATCATTGTCCGATCGAGCGTTCTCGTCC
GCTTGTGCAAaTCCTGCAaTAGCTAACGTGAAAACGATCAGAGCTGTTGTAAATACTCTA
TAAGCGAGATTCATCACATTCCTCcGCCGAAATAAAAAGTTAATTt

>contig00002 длина =554   numreads=4
TGCGCCAaCCGCGCTCTtCATAAaTGGGCACTGCTCCCGATGGCCgACTCGGGCGGTTCG
CCATGAGATCTTTGCCtACCcAGgAaCtCACcACCAAGTCTGATTGCTGTGTGTTTtCTT
CAAGTCCCTATTTCTATTCtCTTtAATGGAACCCGTAGGAAACCCGTGTAGGACGCGGGA
aCCGCACTTgAAGGGGGAGGCGCGGGGTACCGGtCCGGGAACGTACGGGTACCGGCGGGG
gAGGGGAGGGGGACCgCTCCGGGAAGGCCAGGGGACGGATTGGGGAAGGgCGGGTACCGA
AGCGGGgAAaTGGGggAaCcGGCGAGAGGGTTCCTCGCTAAGTGGGGGAAATaGGGGAAA
GGTTGACCAGTGGTtCCCcGCTCTCGTAACATGCCTCAGATAGCGCCATCCGCTGTACCT
GGtcaggtcGctggcaacttcggccgagcaggtgaacccgaaaggtgagggtcagtgtga
cacaccaaccgaacaccgacgaggcaagcgtaggagccggcgtggccgcgcccggcggcg
ctgaggactcctcg

Код для чтения последовательности можно найти здесь.

Это дает правильный вывод, как показано ниже с разделением табуляции:

contig00001   586   52.38
contig00002   554   62.45

Проблема в том, что я разработал форму в NetBeans, которая состоит из JTable имеющий 5 столбцов т.е.

"contigID","Description","Organism","Sequence_length","Gc_percentage" 

и JTextArea, Я хочу отобразить вышеуказанный вывод в JTable столбцы, в то время как другие столбцы остаются пустыми; и когда я нажимаю "contig00001" в JTable, то соответствующая последовательность, такая как "CGGGAAAT...." должна отображаться в JTextArea,

Как я могу это сделать? Любое предложение будет оценено.

2 ответа

Я не совсем уверен, на чем ты застрял. Если он добавляет данные в JTable, я бы рассмотрел создание объекта DefaultTableModel, построение его с правильным заголовком столбца Strings в массиве с 0 строками данных, а затем добавление рядов данных по мере чтения файлов. Учебник JTable должен помочь вам сделать все это. Создав модель таблицы, вы можете легко добавить ее в JTable с помощью метода setModel.

Одним из подходов является расширение AbstractTableModel, как обсуждалось в разделе Создание табличной модели.

Приложение: прослушивая выбор пользователя, вы можете определить, какая строка была выбрана, и обновить свой JTextArea соответственно.

Приложение: поскольку получение данных может быть продолжительным, SwingWorker предлагает безопасный способ мутировать TableModel, Вот простой пример.

Другие вопросы по тегам