Подготовка Perl-файла для запуска с Ubuntu и tabix

Question

Я не знаю об Ubunto или Perl, но мне все еще нужно установить и запустить на нем программу. Вот на что я смотрю: http://vcftools.sourceforge.net/docs.html

В разделе установки написано так:

Чтобы собрать исполняемый файл vcftools, введите "make" в папке vcftools.

Сценарии Perl требуют, чтобы файлы VCF сжимались с помощью bgzip и индексировались с помощью tabix (оба инструмента являются частью пакета tabix, доступного для загрузки здесь). Оба инструмента должны находиться в каталогах, перечисленных в переменной среды PATH. Для запуска сценариев Perl переменная среды PERL5LIB должна быть настроена на включение модуля Vcf.pm

экспорт PERL5LIB=/ путь / к / ваш / установка /perl

Итак, я извлек и скопировал их папку VCFtools в домашнюю папку Ubuntu. Затем я сказал "make", он выдавал ошибки, затем я пошел и загрузил этот инструмент tabidx, но с этого момента я не знаю, что с ним делать, хорошо, я загружаю tabidx, но что делать дальше и как?

Благодарю.

Answer 1

find / -name Vcf.pm

Если это дает одну - и только одну строку - вы можете сделать это:

export PERL5LIB=$( dirname $( find . -name Vcf.pm ))