Как я могу передать вывод одного PBS в качестве переменной, чтобы установить параметр массива задания для другого сценария PBS
У меня есть один сценарий PBS (сценарий A), который определит количество образцов, которые мне нужно обработать - образцы должны пройти проверку качества.
У меня есть другой сценарий PBS (сценарий B), который представляет собой сценарий массива заданий для пакетной обработки нескольких образцов.
Можно ли передать количество выборок, определенное в сценарии A, в качестве переменной сценарию B, чтобы установить параметры массива задания, например: #PBS -J 1-${samples_to_process}
(Я соединяю две работы вместе, используя -W depend
).
Спасибо!