Как я могу передать вывод одного PBS в качестве переменной, чтобы установить параметр массива задания для другого сценария PBS

У меня есть один сценарий PBS (сценарий A), который определит количество образцов, которые мне нужно обработать - образцы должны пройти проверку качества.

У меня есть другой сценарий PBS (сценарий B), который представляет собой сценарий массива заданий для пакетной обработки нескольких образцов.

Можно ли передать количество выборок, определенное в сценарии A, в качестве переменной сценарию B, чтобы установить параметры массива задания, например: #PBS -J 1-${samples_to_process}

(Я соединяю две работы вместе, используя -W depend).

Спасибо!

0 ответов

Другие вопросы по тегам