Возможно ли иметь более одного динамического подстановочного знака в моем конвейере snakemake?

У меня есть рабочий конвейер snakemake с динамическим подстановочным знаком. Однако, когда я пытаюсь добавить новые правила, которые используют новый / другой динамический подстановочный знак, тогда все перестает работать.

Мой вопрос: могу ли я иметь более одного динамического шаблона в моем конвейере?

Вот мой общий рабочий процесс

  1. Бин метагеномный читает в кластеры видов
  2. Используя белки fast of каждого бина / вида, создайте модель масштаба генома для каждого бина (для этого требуется один динамический подстановочный знак)
  3. Использование ДНК-фаста каждого бина / вида генерирует отчет о численности и классификации для каждого бина (для этого требуется еще один шаблон)

Мой второй вопрос: есть ли другой подход, помимо использования dynamic(), который удовлетворит мои требования? Или мне обязательно нужно использовать dynamic()?

Я могу опубликовать свои правила / код, если это поможет ответить на мой вопрос. Заранее спасибо.

0 ответов

Другие вопросы по тегам