Список всех допустимых параметров и критериев, которые могут использоваться в запросах RMA

Question

Я хотел бы получить конкретные модели нейронов, и, хотя я полагаю, что понимаю систему запросов RMA, я не могу найти список допустимых ключевых слов / аргументов / критериев / параметров, которые бы соответствовали тому, что я ищу. Например, "homo sapiens" как вид донора является действительным и имеет смысл. Но если "m__biophys_perisomatic" возвращает все клетки с перизоматическими биофизическими моделями, то как насчет "всех активных" (только в качестве примера, меня будут интересовать многие другие категории)?

Я предполагаю, что это очевидно, но я не буду натыкаться на это, пока я не отправлю этот вопрос.

Answer 1

Спасибо за ваш вопрос. Вы можете увидеть, какие поля и ассоциации доступны для таблицы, используя describe маршрут. Например:

http://api.brain-map.org/api/v2/data/NeuronalModel/describe.xml

От вашего вопроса, я полагаю, вы смотрите на эту таблицу:

http://api.brain-map.org/api/v2/data/ApiCellTypesSpecimenDetail/describe.xml

Ты можешь использовать m__biophys_all_active чтобы увидеть, имеет ли ячейка в этой таблице полностью активную модель.

К вашему сведению: ApiCellTypesSpecimenDetail Таблица - это денормализованная таблица, что означает, что она объединяет сложный набор отношений между таблицами в одну плоскую таблицу.

Вы также можете использовать следующий, более общий запрос, чтобы найти все активные модели.

http://api.brain-map.org/api/v2/data/query.xml?criteria=model::NeuronalModel,rma::criteria,neuronal_model_template[name$eq'Biophysical - все активные ']&num_rows=150