Тепловая карта дендрограммы на основе корреляции в R

Question

У меня есть тепловая карта, которая выглядит так в R:

col<- colorRampPalette(c("red","white", "blue"))(10)
library("gplots")
heatmap.2(qq,scale="none",col=col,trace="none",density.info="none",dendrogram="column")

Но затем я сделал отдельный кластерный анализ на основе корреляции, который получился следующим образом:

library(Hmisc)
plot(varclus(qq,similarity="spearman"))

Как я могу изменить свою тепловую карту так, чтобы кластеризация была идентична кластерному анализу, который я сделал с корреляцией? Мне нужно как-то изменить heatmap.2 функция (или, возможно, использовать другую функцию), чтобы основываться на корреляции Пирсона. Есть идеи?

Answer 1

Пытаться

col<- colorRampPalette(c("red","white", "blue"))(10)
library("gplots")

library(Hmisc)
v <- varclus(qq,similarity="spearman")

devtools::install_github('talgalili/dendextend')
library(dendextend)

dend <- as.dendrogram(v) # comes from dendextend. The same as as.dendrogram(v$hclust)

heatmap.2(qq,scale="none",col=col,trace="none",density.info="none",dendrogram="column", Colv = dend)

(поскольку qq не существует, я не могу воспроизвести изображение)